RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 PAK5Q9P286 719 aa18.38■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 LRIT1Q9P2V4 623 aa18.38■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC23A2Q9UGH3 650 aa18.38■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 VEGFDO43915 354 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 SUN1O94901 812 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 CDK14O94921 469 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 GLB1P16278 677 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 XIAPP98170 497 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 PDE1BQ01064 536 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 SEMA5AQ13591 1074 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 SEPT6Q14141 434 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 GPRC6AQ5T6X5 926 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 LINC00523Q86TU6 105 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF547Q8IVP9 402 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 ARL14Q8N4G2 192 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 OR6C4Q8NGE1 309 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 HOMER3Q9NSC5 361 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 TBC1D29Q9UFV1 150 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa18.37■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC78A2IDD5 438 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 GPR89AB7ZAQ6 455 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF185O15231 689 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 SNX2O60749 519 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 SRP72O76094 671 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 PROS1P07225 676 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 APRTP07741 180 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 GPR89BP0CG08 455 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 MSNP26038 577 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 CCL7P80098 99 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 PEX6Q13608 980 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 ITGA9Q13797 1035 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 TTC27Q6P3X3 843 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRTM4Q86VH4 590 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 DNAAF3Q8N9W5 541 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 DDHD1Q8NEL9 900 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM96AQ9H5X1 160 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 ASB8Q9H765 288 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 KLC4Q9NSK0 619 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 APPL1Q9UKG1 709 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 SNX12Q9UMY4 172 aa18.36■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 KMOO15229 486 aa18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 CSO75390 466 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 CDH17Q12864 832 aa18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 NFATC2Q13469 925 aa18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC38Q502W7 563 aa18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 LDLRAP1Q5SW96 308 aa18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 MDM1Q8TC05 714 aa18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 NAT14Q8WUY8 206 aa18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 TTC25Q96NG3 672 aa18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 DEPDC7Q96QD5 511 aa18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 SMOXQ9NWM0 555 aa18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 RP1P56715 2156 aa18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 IGF2RP11717 2491 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A1W2PQM1 296 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 A6NCN8 305 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 MROH6A6NGR9 719 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 RHPN2P1A8MT19 583 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 PPM1DO15297 605 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 CAPNS1P04632 268 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 HADHAP40939 763 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 CTSCP53634 463 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 GNG11P61952 73 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 BASP1P80723 227 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 GTF2H3Q13889 308 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 SPIDRQ14159 915 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 INSCQ1MX18 579 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 ISXQ2M1V0 245 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 SPRED1Q7Z699 444 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 C11orf96Q7Z7L8 435 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 CCNJLQ8IV13 435 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 ACTRT1Q8TDG2 376 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC37A2Q8TED4 501 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 LRRN3Q9H3W5 708 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 CASS4Q9NQ75 786 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 PRDM8Q9NQV8 689 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa18.34■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 MYLKQ15746 1914 aa18.33■□□□□ 0.53
GCSHP2-201ENST00000560971 B4GAT1O43505 415 aa18.33■□□□□ 0.52
GCSHP2-201ENST00000560971 TCEA3O75764 348 aa18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms