RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557076.5

SCFD1-223, Transcript of sec1 family domain containing 1, human

TSL 3

Gene SCFD1, Length 743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCFD1-223	ENST00000557076	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CLIC2	O15247	247 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ZW10	O43264	779 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TSPAN6	O43657	245 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CDC14B	O60729	498 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CBX6	O95503	412 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CPNE6	O95741	557 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CTSL	P07711	333 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PRKAR1A	P10644	381 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CTSE	P14091	401 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	NR1D1	P20393	614 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CASP4	P49662	377 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CYP2J2	P51589	502 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	THOP1	P52888	689 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	DPT	Q07507	201 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	NFYC	Q13952	458 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076		Q6ZSN1	163 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	GKN2	Q86XP6	184 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	LGI2	Q8N0V4	545 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	RNF103	O00237	685 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	TULP2	O00295	520 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PRODH	O43272	600 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	EXOC3	O60645	756 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	RFPL1	O75677	317 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	MT-CO1	P00395	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ADRB3	P13945	408 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PDC	P20941	246 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ITGA3	P26006	1051 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	ACRV1	P26436	265 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CD1C	P29017	333 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	NEK3	P51956	506 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	LIMK2	P53671	638 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PMS2	P54278	862 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	RAD23B	P54727	409 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	RRAD	P55042	308 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	DAOA	P59103	153 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	NUCB2	P80303	420 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
SCFD1-223	ENST00000557076	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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