RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531473.5

TSTA3-214, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSTA3, Length 2,220 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-214ENST00000531473 APOA4P06727 396 aa20.08■□□□□ 0.81
TSTA3-214ENST00000531473 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
TSTA3-214ENST00000531473 SAT1P21673 171 aa20.08■□□□□ 0.81
TSTA3-214ENST00000531473 PIK3R1P27986 724 aa20.08■□□□□ 0.81
TSTA3-214ENST00000531473 VIPR2P41587 438 aa20.08■□□□□ 0.81
TSTA3-214ENST00000531473 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TSTA3-214ENST00000531473 GPR141Q7Z602 305 aa20.08■□□□□ 0.81
TSTA3-214ENST00000531473 GPR180Q86V85 440 aa20.08■□□□□ 0.81
TSTA3-214ENST00000531473 EME1Q96AY2 570 aa20.08■□□□□ 0.81
TSTA3-214ENST00000531473 TADA1Q96BN2 335 aa20.08■□□□□ 0.81
TSTA3-214ENST00000531473 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TSTA3-214ENST00000531473 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.08■□□□□ 0.81
TSTA3-214ENST00000531473 COQ6Q9Y2Z9 468 aa20.08■□□□□ 0.81
TSTA3-214ENST00000531473 GLP2RO95838 553 aa20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 PGGT1BP53609 377 aa20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 KCNC3Q14003 757 aa20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 USP10Q14694 798 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 PTPRCAPQ14761 206 aa20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 TGFBIQ15582 683 aa20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 ZBED5Q49AG3 693 aa20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 KCTD3Q9Y597 815 aa20.08■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 ANKRD36A6QL64 1941 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 FUOMA2VDF0 154 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 HTR3EA5X5Y0 456 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 TRIM64CA6NLI5 447 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 SOBPA7XYQ1 873 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF24P17028 368 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 HALP42357 657 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 SEPT6Q14141 434 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 HERC3Q15034 1050 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 UGP2Q16851 508 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 KRT80Q6KB66 452 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF781Q8N8C0 355 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 STON2Q8WXE9 905 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 SAMD11Q96NU1 681 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 MGME1Q9BQP7 344 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 FBP2O00757 339 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 KLHL41O60662 606 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 HLA-FP30511 346 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 GKP32189 559 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 TNK2Q07912 1038 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 ZNF77Q15935 545 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 NAT16Q8N8M0 369 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 DDHD1Q8NEL9 900 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 RDH11Q8TC12 318 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 ISOC1Q96CN7 298 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 PSKH2Q96QS6 385 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 TM6SF2Q9BZW4 377 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 PALMDQ9NP74 551 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 OLAHQ9NV23 265 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 INSIG1O15503 277 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 VAPBO95292 243 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 ARNTP27540 789 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 HK2P52789 917 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 CCDC80Q76M96 950 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 SNX32Q86XE0 403 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 CPXM2Q8N436 756 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 TERB1Q8NA31 727 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 RMI1Q9H9A7 625 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 TCF7L2Q9NQB0 619 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 OXSMQ9NWU1 459 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 MSRAQ9UJ68 235 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 A0A087WXM4 84 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 A0A1B0GTW7 788 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 C7orf72A4D263 438 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 OCM2P0CE71 109 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 CR2P20023 1033 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 CSRP3P50461 194 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 MS4A2Q01362 244 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 CEACAM7Q14002 265 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 KCTD21Q4G0X4 260 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 DCDC5Q6ZRR9 648 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 ASIC4Q96FT7 647 aa20.06■□□□□ 0.8
TSTA3-214ENST00000531473 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms