RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TLR10Q9BXR5 811 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNF1Q9H3M0 494 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC23A2Q9UGH3 650 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 FKBPLQ9UIM3 349 aa18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 CHUKO15111 745 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 PPM1DO15297 605 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT1A9O60656 530 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAMEF1O95521 474 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 ETS1P14921 441 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT1A6P19224 532 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT1A1P22309 533 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT1A4P22310 534 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 CSF2RBP32927 897 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT1A3P35503 534 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT1A5P35504 534 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 B4GALNT1Q00973 533 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX1Q13596 522 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4K2Q8NGD2 314 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 OR6C4Q8NGE1 309 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 RTP4Q96DX8 246 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 DCBLD2Q96PD2 775 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 RMI1Q9H9A7 625 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT1A7Q9HAW7 530 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT1A10Q9HAW8 530 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT1A8Q9HAW9 530 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 RDH14Q9HBH5 336 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM39Q9HCM9 518 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 PKP3Q9Y446 797 aa18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 CHD6Q8TD26 2715 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 B4GAT1O43505 415 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX2O60749 519 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 PNLIPP16233 465 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 CXCR5P32302 372 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 CTSCP53634 463 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 NR1D2Q14995 579 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 AMZ1Q400G9 498 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXR1Q6PIV2 292 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 SFRP1Q8N474 314 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 GDAP1Q8TB36 358 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 NUDT22Q9BRQ3 303 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 EPB41L5Q9HCM4 733 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 ASCL3Q9NQ33 180 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 PRDM8Q9NQV8 689 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 KLC4Q9NSK0 619 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 LOC400499M0QZD8 3231 aa18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2-218ENST00000511185 PRR19A6NJB7 356 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 RHPN2P1A8MT19 583 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 STX7O15400 261 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 HGFP14210 728 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 TPH1P17752 444 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 TMPRSS15P98073 1019 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 INSCQ1MX18 579 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 PARP6Q2NL67 630 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP9Q49MG5 647 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 GPRC6AQ5T6X5 926 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 NKAIN2Q5VXU1 208 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf96Q7Z7L8 435 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRTM4Q86VH4 590 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 DDHD1Q8NEL9 900 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR48Q8TAF3 677 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CRELD1Q96HD1 420 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 SDK2Q58EX2 2172 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC78A2IDD5 438 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 LDB2O43679 373 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 AP2A1O95782 977 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 IFNB1P01574 187 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 LPOP22079 712 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ALDH4A1P30038 563 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 FASLGP48023 281 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 XIAPP98170 497 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 PEX6Q13608 980 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 P3H1Q32P28 736 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D25Q3MII6 688 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 C19orf48Q6RUI8 117 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 SLITRK4Q8IW52 837 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM58Q8NG06 486 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 SEMA6CQ9H3T2 930 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC40Q9H9A6 602 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 SMOXQ9NWM0 555 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM9Q9P0T7 183 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa18.44■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2AG2A6NM03 316 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR89AB7ZAQ6 455 aa18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SH3BP2-218ENST00000511185 CDK14O94921 469 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms