RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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PRPF40A-210ENST00000489741 CSF2P04141 144 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PRB1P04280 392 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ADRB3P13945 408 aa6.45□□□□□ -1.38
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PRPF40A-210ENST00000489741 OR1E1P30953 314 aa6.45□□□□□ -1.38
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PRPF40A-210ENST00000489741 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.45□□□□□ -1.38
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PRPF40A-210ENST00000489741 CENPTQ96BT3 561 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 WBP1Q96G27 269 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TBATAQ96M53 351 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.44□□□□□ -1.38
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PRPF40A-210ENST00000489741 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.44□□□□□ -1.38
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