RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 SLU7O95391 586 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 TGDSO95455 350 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 ICAM1P05362 532 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SRCP12931 536 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SELLP14151 372 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CAPZA2P47755 286 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 NRIP1P48552 1158 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CLCNKAP51800 687 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 RRP1P56182 461 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 BNC1Q01954 994 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SREBF2Q12772 1141 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 TCP11X2Q5H9J9 407 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 IL27RAQ6UWB1 636 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 MCEMP1Q8IX19 187 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 BEST3Q8N1M1 668 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 OR1J2Q8NGS2 313 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 GSDMBQ8TAX9 411 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 RSPH1Q8WYR4 309 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 MIB2Q96AX9 1013 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 MTBPQ96DY7 904 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PHF21BQ96EK2 531 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 GAD1Q99259 594 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SPRY4Q9C004 299 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 NOX4Q9NPH5 578 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 GIMAP4Q9NUV9 329 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 WNT16Q9UBV4 365 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 STK39Q9UEW8 545 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 ANAPC5Q9UJX4 755 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SNX9Q9Y5X1 595 aa4.94□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 OR2A25A4D2G3 310 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CLEC18AA5D8T8 446 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 UBE2CO00762 179 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 RFPL2O75678 378 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 GGPS1O95749 300 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 TUBBP07437 444 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SSTR2P30874 369 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CLK1P49759 484 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 LINC00205P59089 165 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 TRAF3Q13114 568 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 KCNC3Q14003 757 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PCLAFQ15004 111 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 OASLQ15646 514 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 DECR1Q16698 335 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 KYNUQ16719 465 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 XKR9Q5GH70 373 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 GARNL3Q5VVW2 1013 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 WDR73Q6P4I2 378 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 RAPH1Q70E73 1250 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CEP97Q8IW35 865 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 UNC45BQ8IWX7 931 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 THNSL1Q8IYQ7 743 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 NUP93Q8N1F7 819 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 IL17RCQ8NAC3 791 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CLEC18CQ8NCF0 446 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 ELP5Q8TE02 316 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 TAAR8Q969N4 342 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 OR1F2PQ96R84 312 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 TMEM39BQ9GZU3 492 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PCDH9Q9HC56 1237 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PFDN4Q9NQP4 134 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 MCM9Q9NXL9 1143 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 LOXL2Q9Y4K0 774 aa4.93□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PR77 199 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 H0Y626 953 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 HS3ST1O14792 307 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 SP100P23497 879 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 ITGB8P26012 769 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 HOXC13P31276 330 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PEX5P50542 639 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PNLIPRP2P54317 469 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 TAS2R38P59533 333 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 PSMC6P62333 389 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 TMF1P82094 1093 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 RBP5P82980 135 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 DDR1Q08345 913 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 TFCP2Q12800 502 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 BFSP1Q12934 665 aa4.92□□□□□ -1.62
CCL20-204ENST00000489160 CALCRLQ16602 461 aa4.92□□□□□ -1.62
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