RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 KLHL35Q6PF15 583 aa5.78□□□□□ -1.48
USP34-216ENST00000487547 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
USP34-216ENST00000487547 TSPAN33Q86UF1 283 aa5.78□□□□□ -1.48
USP34-216ENST00000487547 TEX11Q8IYF3 940 aa5.78□□□□□ -1.48
USP34-216ENST00000487547 EMC1Q8N766 993 aa5.78□□□□□ -1.48
USP34-216ENST00000487547 OR8K5Q8NH50 307 aa5.78□□□□□ -1.48
USP34-216ENST00000487547 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
USP34-216ENST00000487547 PPP4R1Q8TF05 950 aa5.78□□□□□ -1.48
USP34-216ENST00000487547 SEMA3CQ99985 751 aa5.78□□□□□ -1.48
USP34-216ENST00000487547 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa5.78□□□□□ -1.48
USP34-216ENST00000487547 LRMDAQ9H2I8 198 aa5.78□□□□□ -1.48
USP34-216ENST00000487547 EPB41L5Q9HCM4 733 aa5.78□□□□□ -1.48
USP34-216ENST00000487547 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
USP34-216ENST00000487547 SESN1Q9Y6P5 492 aa5.78□□□□□ -1.48
USP34-216ENST00000487547 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 PI4KAP2A4QPH2 592 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 TMCC2O75069 709 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ACADMP11310 421 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SREBF2Q12772 1141 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 CDC16Q13042 620 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 KRTCAP3Q53RY4 240 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 OR7E24Q6IFN5 339 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 KCTD8Q6ZWB6 473 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SMIM29Q86T20 159 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 EPHX4Q8IUS5 362 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ACVR1CQ8NER5 493 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 HMGCLL1Q8TB92 370 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 TRPC4APQ8TEL6 797 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SCFD2Q8WU76 684 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 NR4A3Q92570 626 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 USP6NLQ92738 828 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SCRN2Q96FV2 425 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 CCDC34Q96HJ3 373 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 PGAM5Q96HS1 289 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 CMTM3Q96MX0 182 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 PCYT2Q99447 389 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 MTMR10Q9NXD2 777 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 PADI3Q9ULW8 664 aa5.77□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 PRAG1Q86YV5 1406 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 C15orf62A8K5M9 175 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 FAM72CH0Y354 149 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SYNGR3O43761 229 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 USO1O60763 962 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 BAIAP3O94812 1187 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ICAM1P05362 532 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 TNFAIP3P21580 790 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 CTSCP53634 463 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ARF1P84077 181 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 LRIF1Q5T3J3 769 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 FAM72AQ5TYM5 149 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SNX30Q5VWJ9 437 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 JADE1Q6IE81 842 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 FAM72DQ6L9T8 149 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 C19orf48Q6RUI8 117 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 IKBIPQ70UQ0 350 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 FAM72BQ86X60 149 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SLC38A9Q8NBW4 561 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SLC38A5Q8WUX1 472 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 EGLN2Q96KS0 407 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 PIGMQ9H3S5 423 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ZFP57Q9NU63 452 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 TAF1P21675 1872 aa5.76□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 HS6ST1O60243 411 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SP1P08047 785 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 RARGP13631 454 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 GM2AP17900 193 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 AHRP35869 848 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ZNF628Q5EBL2 1059 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 FAM171BQ6P995 826 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ZNF852Q6ZMS4 543 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 CCDC190Q86UF4 302 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SLC5A8Q8N695 610 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 KBTBD3Q8NAB2 608 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ABHD8Q96I13 439 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 TCF19Q9Y242 345 aa5.75□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 NOTCH4Q99466 2003 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 FRMD3A2A2Y4 597 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 CTAGE9A4FU28 777 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 OR5K3A6NET4 321 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 A8MZ25 164 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.491e-6■■□□□ 12.7
USP34-216ENST00000487547 CTAGE8P0CG41 777 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms