RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486621.1

TTC4-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 4, human

TSL 2

Gene TTC4, Length 549 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC4-204	ENST00000486621	CTRC	Q99895	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	FOXC2	Q99958	501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	STX6	O43752	255 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	RASGRP1	O95267	797 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	TNF	P01375	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	CD1C	P29017	333 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ADORA2B	P29275	332 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ATIC	P31939	592 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	CASP14	P31944	242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	CHRNA3	P32297	505 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF131	P52739	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	IST1	P53990	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	FOXL1	Q12952	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	BIRC2	Q13490	618 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	TRIM29	Q14134	588 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF235	Q14590	738 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	DLG2	Q15700	870 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	BMPER	Q8N8U9	685 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	RNF139	Q8WU17	664 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	PLIN2	Q99541	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	C5AR2	Q9P296	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ARGFX	A6NJG6	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	MATN2	O00339	956 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	KRIT1	O00522	736 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF185	O15231	689 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	CLIC2	O15247	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ACSL4	O60488	711 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	CUTA	O60888	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	CEACAM4	O75871	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	CTSL	P07711	333 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	THRA	P10827	490 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	TNNI1	P19237	187 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	HTR1B	P28222	390 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	GPR3	P46089	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	PEX5	P50542	639 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	VAMP7	P51809	220 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	NEK3	P51956	506 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ASIC2	Q16515	512 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	HYI	Q5T013	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC4-204	ENST00000486621	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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