RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474378.1

PABPC4-211, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 4, humanhuman

TSL 5

Gene PABPC4, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4-211ENST00000474378 SHISA7A6NL88 538 aa5.09□□□□□ -1.59
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PABPC4-211ENST00000474378 LHX3Q9UBR4 397 aa5.09□□□□□ -1.59
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