RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470243.5

SRRM1-208, Transcript of serine and arginine repetitive matrix 1, human

TSL 5

Gene SRRM1, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM1-208	ENST00000470243	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CHL1	O00533	1208 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	FGB	P02675	491 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	KLKB1	P03952	638 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	FGF2	P09038	288 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CLTB	P09497	229 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	RFC4	P35249	363 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	ABCG1	P45844	678 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CLCN3	P51790	818 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CDH8	P55286	799 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	C21orf58	P58505	322 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	UBE2H	P62256	183 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	SORD	Q00796	357 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	OLIG2	Q13516	323 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	IRF3	Q14653	427 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	ETFDH	Q16134	617 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243		Q5PR19	223 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	MMP21	Q8N119	569 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	LPAR1	Q92633	364 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	RAD50	Q92878	1312 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	TIMM44	O43615	452 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CAVIN2	O95810	425 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	MMP2	P08253	660 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CSH1	P0DML2	217 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CSH2	P0DML3	217 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	GABRB1	P18505	474 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	MX1	P20591	662 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	ACSL1	P33121	698 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	PIGA	P37287	484 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	PSMB10	P40306	273 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	RAD52	P43351	418 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	PSMC6	P62333	389 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	PPAT	Q06203	517 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	TRAF1	Q13077	416 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	GPR18	Q14330	331 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CRYM	Q14894	314 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	PTGR1	Q14914	329 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243		Q6ZSV7	163 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243		Q7L0L9	218 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	NRAC	Q8N912	160 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	ANKRD7	Q92527	254 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SRRM1-208	ENST00000470243	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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