RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444107.1

GAPDHP20-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 20, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP20, Length 1,007 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP20-201ENST00000444107 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 A0A0U1RQS6 177 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 MROH6A6NGR9 719 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 OR5K4A6NMS3 321 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 AGAP14A8MT82 685 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 CFAP99D6REC4 459 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 QSOX1O00391 747 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 CHUKO15111 745 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 KMOO15229 486 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 INPP4BO15327 924 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 YY2O15391 372 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 GRID2O43424 1007 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 LDB2O43679 373 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 SIGLEC6O43699 453 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 NUAK1O60285 661 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 SDC3O75056 442 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 DNAJC6O75061 913 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 SRP72O76094 671 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 CDK14O94921 469 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 PRAMEF1O95521 474 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 GP1BAP07359 652 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 GSTM1P09488 218 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 CKMT1AP12532 417 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 ETS1P14921 441 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 TPH1P17752 444 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 ITGALP20701 1170 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 ACP1P24666 158 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 ADCY8P40145 1251 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 CLCNKAP51800 687 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 DAB2P98082 770 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 E2F1Q01094 437 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 DR1Q01658 176 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 GSTM4Q03013 218 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 NFATC2Q13469 925 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 PTK6Q13882 451 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 SEPT6Q14141 434 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 POU6F1Q14863 301 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 PROX2Q3B8N5 592 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 PYCR3Q53H96 274 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 HSP90B2PQ58FF3 399 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 ALS2CLQ60I27 953 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 EMBQ6PCB8 327 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 FAM151BQ6UXP7 276 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 RFLNAQ6ZTI6 216 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 HOOK3Q86VS8 718 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 PELI3Q8N2H9 469 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 AVL9Q8NBF6 648 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 BBOF1Q8ND07 529 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 MCUQ8NE86 351 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 WDR48Q8TAF3 677 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 GDAP1Q8TB36 358 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 NAT6Q93015 286 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 CAVIN3Q969G5 261 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 PDXPQ96GD0 296 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 SGSM3Q96HU1 749 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 OR2M4Q96R27 311 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 AGAP2Q99490 1192 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 BOCQ9BWV1 1114 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 ASB8Q9H765 288 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 LAMA1P25391 3075 aa6.69□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 FAM187AA6NFU0 413 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 TRIM38O00635 465 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 PFDN6O15212 129 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 FFAR2O15552 330 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 GIMD1P0DJR0 217 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 PNLIPP16233 465 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 PAMP19021 973 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 MSH3P20585 1137 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 GNPDA1P46926 289 aa6.68□□□□□ -1.34
GAPDHP20-201ENST00000444107 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms