RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSD11B2P80365 405 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 OCA2Q04671 838 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ENPEPQ07075 957 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAPGEF1Q13905 1077 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAG1Q14118 895 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDSNQ15517 529 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB41Q5JT25 222 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 EOGTQ5NDL2 527 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX30Q5VWJ9 437 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PMS2CLQ68D20 193 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP17Q68EM7 881 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PMF1Q6P1K2 205 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DENND1BQ6P3S1 775 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RFWD3Q6PCD5 774 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM65Q6PJ69 517 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TADA2BQ86TJ2 420 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAC4Q86UU9 113 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC15A4Q8N697 577 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q8NA96 180 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD52Q8NB46 1076 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDI1Q8WTU0 396 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX19Q92543 992 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIGKQ92643 395 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA1Q92805 767 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXTL1Q92935 676 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 OTUB2Q96DC9 234 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC138Q96M89 665 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNPPD1Q9BV87 410 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLSTN2Q9H4D0 955 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCB8Q9NUT2 735 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHMP5Q9NZZ3 219 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 XPR1Q9UBH6 696 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLEC4EQ9ULY5 219 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 COQ4Q9Y3A0 265 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.56□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A087WWL8 130 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 BECN2A8MW95 431 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 E5RJQ4 531 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAPN9O14815 690 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 NCR1O76036 304 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFPL1O95159 310 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAVIN2O95810 425 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPANK1O95872 356 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAEPP09466 180 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM163BP0C2L3 166 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 VDRP11473 427 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSHRP16473 764 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHRM3P20309 590 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 NTSR1P30989 418 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 HTR3AP46098 478 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF132P52740 706 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CETN1Q12798 172 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDCLQ13371 301 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FUT11Q495W5 492 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPDYAQ5MJ70 313 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAF3Q5VWG9 929 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 BSPRYQ5W0U4 402 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LYSMD4Q5XG99 296 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LCLAT1Q6UWP7 414 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAYNQ6UX15 382 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHSY1Q86X52 802 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP18Q8N392 663 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC39CQ8N584 583 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF152Q8N8N0 203 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIML1Q8N9V2 468 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 LMO3Q8TAP4 145 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 POC1BQ8TC44 478 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 SGCZQ96LD1 299 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED15Q96RN5 788 aa4.55□□□□□ -1.68
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIB1Q96RU8 372 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms