RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 STK40Q8N2I9 435 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.73□□□□□ -0.85
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HERC3-202ENST00000402738 PHC3Q8NDX5 983 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.73□□□□□ -0.85
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HERC3-202ENST00000402738 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
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HERC3-202ENST00000402738 H3BM21 787 aa9.73□□□□□ -0.85
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HERC3-202ENST00000402738 CAP2P40123 477 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 CD97P48960 835 aa9.73□□□□□ -0.85
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HERC3-202ENST00000402738 NIPA1Q7RTP0 329 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 DSG4Q86SJ6 1040 aa9.73□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
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HERC3-202ENST00000402738 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 FRMD6Q96NE9 622 aa9.72□□□□□ -0.85
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HERC3-202ENST00000402738 PORCNQ9H237 461 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.72□□□□□ -0.85
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HERC3-202ENST00000402738 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 CASTOR2A6NHX0 329 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.72□□□□□ -0.85
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HERC3-202ENST00000402738 CDH12P55289 794 aa9.72□□□□□ -0.85
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HERC3-202ENST00000402738 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa9.72□□□□□ -0.85
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HERC3-202ENST00000402738 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.72□□□□□ -0.85
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HERC3-202ENST00000402738 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.72□□□□□ -0.85
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HERC3-202ENST00000402738 PLD2O14939 933 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 TYROBPO43914 113 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 APOL3O95236 402 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 NR2F1P10589 423 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 GPD2P43304 727 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 GNPDA1P46926 289 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 PPP2R2BQ00005 443 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 CLCQ05315 142 aa9.72□□□□□ -0.85
HERC3-202ENST00000402738 MSS51Q4VC12 460 aa9.72□□□□□ -0.85
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