RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380701.7

CCDC171-201, Transcript of coiled-coil domain containing 171, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC171, Length 6,512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171-201ENST00000380701 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 AAGABQ6PD74 315 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 OR4K2Q8NGD2 314 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SLC38A4Q969I6 547 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PNPLA2Q96AD5 504 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 HAVCR1Q96D42 359 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 OR52E6Q96RD3 313 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 CDRT15Q96T59 188 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 KLHL31Q9H511 634 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 H3BUI4 141 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SERPINA6P08185 405 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 HSMCR30P0CW71 290 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ALDH4A1P30038 563 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SCTRP47872 440 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ARHGDIBP52566 201 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 CHN2P52757 468 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 TAS2R41P59536 307 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ZNF844Q08AG5 666 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PTPN20Q4JDL3 420 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 GCNT6Q5T4J0 391 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 RNF43Q68DV7 783 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 CPNE9Q8IYJ1 553 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 OR4A15Q8NGL6 344 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 THRSPQ92748 146 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 DPEP2Q9H4A9 486 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SNX15Q9NRS6 342 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 XPR1Q9UBH6 696 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 FETUBQ9UGM5 382 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 COQ9O75208 318 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PRAMEF1O95521 474 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 IL12BP29460 328 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ADSSP30520 456 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ECT2LQ008S8 904 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 LCP2Q13094 533 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 HECTD2Q5U5R9 776 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 DUPD1Q68J44 220 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SLC9B2Q86UD5 537 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SFRP1Q8N474 314 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 LINC00471Q8N535 108 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SH3RF2Q8TEC5 729 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 FAR1Q8WVX9 515 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SPOCK2Q92563 424 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 NUS1Q96E22 293 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.12□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PLK4O00444 970 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PITPNM1O00562 1244 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SCELO95171 688 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SOX11P35716 441 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 DGKEP52429 567 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 GPR17Q13304 367 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 TSTD2Q5T7W7 516 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PARGQ86W56 976 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ZNF527Q8NB42 609 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ENKURQ8TC29 256 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 TRIM63Q969Q1 353 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 CREBZFQ9NS37 354 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 CHKBQ9Y259 395 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 DCXO43602 365 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 KCNJ13O60928 360 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SERPINA1P01009 418 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 SOD2P04179 222 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 CLCNKBP51801 687 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 MAPK12P53778 367 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 CASP6P55212 293 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 DMPKQ09013 629 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 MAPK11Q15759 364 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 TCEAL6Q6IPX3 200 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CCDC171-201ENST00000380701 BAP1Q92560 729 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms