RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 TIMM44O43615 452 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 GLUD1P00367 558 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 TPH1P17752 444 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 TNK2Q07912 1038 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF846Q147U1 533 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 OXA1LQ15070 435 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 KIF19Q2TAC6 998 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 RAP1GAP2Q684P5 730 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 SZRD1Q7Z422 152 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 DSG4Q86SJ6 1040 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNMB4Q86W47 210 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 LSMEM2Q8N112 164 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 MFSD2AQ8NA29 543 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 SNX19Q92543 992 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 DHRS1Q96LJ7 313 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 CASD1Q96PB1 797 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 TCAF1Q9Y4C2 921 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 H0Y626 953 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 M0QZQ0 153 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 NRP2O60462 931 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 TBX18O95935 607 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 APOA4P06727 396 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 CAPGP40121 348 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 PLK1P53350 603 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 GALNT2Q10471 571 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 TIGD2Q4W5G0 525 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 KIAA2013Q8IYS2 634 aa11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 MTMR11A4FU01 709 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 NR5A2O00482 541 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 DLX3O60479 287 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 FGF18O76093 207 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 IGFBP4P22692 258 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 OR1E1P30953 314 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNC4Q03721 635 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 CDH18Q13634 790 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 CYP51A1Q16850 503 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 LGI2Q8N0V4 545 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 KDM1BQ8NB78 822 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 HDAC10Q969S8 669 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 P2RY11Q96G91 374 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 CSPG4P5Q96PW8 444 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF347Q96SE7 839 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 CIPCQ9C0C6 399 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 MTSS1O43312 755 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 ALBP02768 609 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 GABRR2P28476 465 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 OXTRP30559 389 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 NR2C2P49116 596 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 IL1RL1Q01638 556 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 POM121L1PQ3SYA9 428 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC25A23Q9BV35 468 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 MROQ9BYG7 248 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 TRIM15Q9C019 465 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 LHPPQ9H008 270 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 POMKQ9H5K3 350 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC28A3Q9HAS3 691 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 PIGVQ9NUD9 493 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 TRIP11Q15643 1979 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 PAGE1O75459 146 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 OAZ2O95190 189 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 KRT75O95678 551 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 RPS9P46781 194 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 PRKAA2P54646 552 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 TMBIM6P55061 237 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 STX1BP61266 288 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 LSM3P62310 102 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM189BP81408 668 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 CREMQ03060 361 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 SQLEQ14534 574 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 CERCAMQ5T4B2 595 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 NEPROQ6NW34 567 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 CRTC3Q6UUV7 619 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 CLEC14AQ86T13 490 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 SPNS2Q8IVW8 549 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 PACRGLQ8N7B6 248 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 OR13F1Q8NGS4 319 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 LINC01599Q8WXQ3 324 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 SEPHS2Q99611 448 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 CCDC90BQ9GZT6 254 aa11.11□□□□□ -0.63
RPRD1B-201ENST00000373433 IL22Q9GZX6 179 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms