RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368656.6

FAM229B-201, Transcript of family with sequence similarity 229 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM229B, Length 2,543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM229B-201ENST00000368656 NUDT2P50583 147 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 PRAMEP78395 509 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 KCNC4Q03721 635 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 KLF10Q13118 480 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 SEMA3AQ14563 771 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 GPR158Q5T848 1215 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 SEL1L3Q68CR1 1132 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 LRRC49Q8IUZ0 686 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 TEX26Q8N6G2 289 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 SPPL2BQ8TCT7 592 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 EXT2Q93063 718 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 CDRT15Q96T59 188 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 RNF38Q9H0F5 515 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 POMKQ9H5K3 350 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 CXorf21Q9HAI6 301 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 SMPD4Q9NXE4 827 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 GTSE1Q9NYZ3 720 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 BCAP29Q9UHQ4 241 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 SLC8A2Q9UPR5 921 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 PRELID1Q9Y255 219 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 RAP2CQ9Y3L5 183 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 ANKRD12Q6UB98 2062 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 REV3LO60673 3130 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 PLXNA3P51805 1871 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 A0A087WXM4 84 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 MROH6A6NGR9 719 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 NOTOA8MTQ0 251 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 F5H5T6 163 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 H3BMQ9 156 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 HDAC3O15379 428 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 PRAMEF11O60813 436 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 BMP10O95393 424 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 S1PR4O95977 384 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 IGLV3-27P01718 113 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 INHBBP09529 407 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 NR4A1P22736 598 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 THOP1P52888 689 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 PKNOX1P55347 436 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 IL10RBQ08334 325 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 TRAF2Q12933 501 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 ZNF235Q14590 738 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 FBXO48Q5FWF7 155 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 HECTD2Q5U5R9 776 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 PPP2R2DQ66LE6 453 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 LINGO4Q6UY18 593 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 CILP2Q8IUL8 1156 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 SIX5Q8N196 739 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 CRIPAKQ8N1N5 446 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 SNX31Q8N9S9 440 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 FAM47BQ8NA70 645 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 PXYLP1Q8TE99 480 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 COG8Q96MW5 612 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 DEFB118Q96PH6 123 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 CTRCQ99895 268 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 OSBPL11Q9BXB4 747 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 PRKD2Q9BZL6 878 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 UNC93B1Q9H1C4 597 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 ALG9Q9H6U8 611 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 COQ10BQ9H8M1 238 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 PALMDQ9NP74 551 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 CDH7Q9ULB5 785 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 ERVK-11Q9UQG0 969 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 VWA7Q9Y334 891 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 AP4S1Q9Y587 144 aa5.85□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 A0A1W2PQ67 120 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 C2orf78A6NCI8 922 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 C2orf72A6NCS6 295 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 TRIM64CA6NLI5 447 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 CBX4O00257 560 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 COCHO43405 550 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 ACSL4O60488 711 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 GMNNO75496 209 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 CSPG5O95196 566 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 CHEK2O96017 543 aa5.84□□□□□ -1.47
FAM229B-201ENST00000368656 GOT2P00505 430 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms