RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 KRT38O76015 456 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NEBLO76041 1014 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GBAP04062 536 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 UROSP10746 265 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KITLGP21583 273 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ACHEP22303 614 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PRPH2P23942 346 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PCYT1AP49585 367 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NT5C2P49902 561 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GPS1Q13098 491 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DNASE1L3Q13609 305 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 LAMB3Q13751 1172 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 BMPR2Q13873 1038 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FLOT2Q14254 428 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL26Q53HC5 615 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CFAP157Q5JU67 520 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 AFMIDQ63HM1 303 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM154Q6P9G4 183 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DCLK2Q8N568 766 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 METTL25Q8N6Q8 603 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TRIML2Q8N7C3 387 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 OR6J1Q8NGC5 347 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 OR52K1Q8NGK4 314 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SLC35B2Q8TB61 432 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ITFG2Q969R8 447 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ARRDC3Q96B67 414 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SIPA1Q96FS4 1042 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NACAP1Q9BZK3 213 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FZD8Q9H461 694 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGEF3Q9NR81 526 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SPANXCQ9NY87 97 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 HAO2Q9NYQ3 351 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 STOML1Q9UBI4 398 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 RTL1A6NKG5 1358 aa2.51□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GBF1Q92538 1859 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 C9orf172C9J069 976 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SOCS6O14544 535 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KRT86O43790 486 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ERLIN1O75477 346 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CHRM4P08173 479 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PDHBP11177 359 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PRLRP16471 622 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SAT1P21673 171 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CCNCP24863 283 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PPIFP30405 207 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 UQCRC1P31930 480 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PITPNBP48739 271 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SULT1E1P49888 294 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ACY1Q03154 408 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ITIH3Q06033 890 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SPAG1Q07617 926 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PKP1Q13835 747 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CEP78Q5JTW2 689 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TAOK1Q7L7X3 1001 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 VASH2Q86V25 355 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FAM160B2Q86V87 743 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SCYL3Q8IZE3 742 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CLEC4CQ8WTT0 213 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL29Q96CT2 875 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL15Q96M94 604 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 WDR92Q96MX6 357 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MUS81Q96NY9 551 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PKP2Q99959 881 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MGME1Q9BQP7 344 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NFKBIZQ9BYH8 718 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 EGLN1Q9GZT9 426 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CTDSP1Q9GZU7 261 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NACA2Q9H009 215 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SMYD3Q9H7B4 428 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CXorf36Q9H7Y0 433 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DLL4Q9NR61 685 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ASAH2Q9NR71 780 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM140Q9NV12 185 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SETD4Q9NVD3 440 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PSD3Q9NYI0 1048 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D7Q9P0N9 293 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0G2JPF8 293 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ANKDD1BA6NHY2 528 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CAPN14A8MX76 684 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 H0YIV9 168 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GOLGA8SH3BPF8 625 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 IKBKBO14920 756 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CHADO15335 359 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ALX3O95076 343 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TPBGLP0DKB5 382 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms