RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 UFD1Q92890 307 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 C8orf48Q96LL4 319 aa4.89□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 GALNT8Q9NY28 637 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 E2F8A0AVK6 867 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 B8ZZF3 427 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 H3BRB1 525 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CTDNEP1O95476 244 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 FBXW4P57775 412 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 GRB10Q13322 594 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SP140Q13342 867 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 TMC7Q7Z402 723 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 QSER1Q2KHR3 1735 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DUXAA6NLW8 204 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TLL1O43897 1013 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 ITGB3P05106 788 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 ALDH3A2P51648 485 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 RPS9P46781 194 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CD47Q08722 323 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DGKZQ13574 1117 aa4.88□□□□□ -1.63
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