RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 ANXA8L1Q5VT79 327 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 SULT1C3Q6IMI6 304 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 CRTC3Q6UUV7 619 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 CPNE9Q8IYJ1 553 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 UNC5BQ8IZJ1 945 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 DSELQ8IZU8 1212 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 LRTM1Q9HBL6 345 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 PCDH12Q9NPG4 1184 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 ARHGEF3Q9NR81 526 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 MIOSQ9NXC5 875 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 NTRK1P04629 796 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 ETS2P15036 469 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 ACVRL1P37023 503 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 CRATP43155 626 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 SCAPQ12770 1279 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 C16orf72Q14CZ0 275 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 TSNQ15631 228 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 PROSER1Q86XN7 944 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 PANX1Q96RD7 426 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 OXSMQ9NWU1 459 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 MYADML2A6NDP7 307 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 RFXANKO14593 260 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 CLDN9O95484 217 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 APLP1P51693 650 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 SNX20Q7Z614 316 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 KIFC1Q9BW19 673 aa16.38■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 E7ESA3 106 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 UBXN8O00124 270 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 BEST1O76090 585 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 GSTM1P09488 218 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 RING1Q06587 406 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 GPR22Q99680 433 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 RETREG1Q9H6L5 497 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 ACSS2Q9NR19 701 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 SLC17A6Q9P2U8 582 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 TIMM22Q9Y584 194 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 A0A087WXM4 84 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 KRT75O95678 551 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 HPGDP15428 266 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 SPIDRQ14159 915 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 CLEC6AQ6EIG7 209 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 C7orf61Q8IZ16 206 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 GPR156Q8NFN8 814 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 ING5Q8WYH8 240 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 KLHL32Q96NJ5 620 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 DNAJB4Q9UDY4 337 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 NRF1Q16656 503 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 CARD16Q5EG05 197 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 TTC23Q5W5X9 447 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 CDH22Q9UJ99 828 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 PSMD13Q9UNM6 376 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 EPHX1P07099 455 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 TRPC1P48995 793 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 TXNDC8Q6A555 127 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 VPS4AQ9UN37 437 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 TPRKBQ9Y3C4 175 aa16.37■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 PRAMEF11O60813 436 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 PGM3O95394 542 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 C8GP07360 202 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 HSPA7P48741 367 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 CHN2P52757 468 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 BHLHB9Q6PI77 547 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 IGSF21Q96ID5 467 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 ABCG8Q9H221 673 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 INSL5Q9Y5Q6 135 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 EPOP01588 193 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 ITPKAP23677 461 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 IRF9Q00978 393 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 GTF2H2Q13888 395 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 RINLQ6ZS11 566 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 SVOPQ8N4V2 548 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.36■□□□□ 0.21
ITGA3-202ENST00000320031 GRIP2Q9C0E4 1043 aa16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms