RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 CENPTQ96BT3 561 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMC6Q96SB8 1091 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 BOCQ9BWV1 1114 aa27.16■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRPM6Q9BX84 2022 aa27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PPM1 405 aa27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 H3BMM5 538 aa27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPP1O14773 563 aa27.15■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NUDT1P36639 197 aa27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 INPP5AQ14642 412 aa27.15■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC36A4Q6YBV0 504 aa27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAPH1Q70E73 1250 aa27.15■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 PELI3Q8N2H9 469 aa27.15■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR26Q9H7D7 661 aa27.15■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 E5RI56 91 aa27.14■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RHOBTB1O94844 696 aa27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF549Q6P9A3 640 aa27.14■■□□□ 1.94
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PCED1AQ9H1Q7 454 aa27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 P2RY12Q9H244 342 aa27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAB39LQ9H9S4 337 aa27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 FZD3Q9NPG1 666 aa27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNX15Q9NRS6 342 aa27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 TLK1Q9UKI8 766 aa27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACTL7BQ9Y614 415 aa27.14■■□□□ 1.94
CTDNEP1-201ENST00000318988 TECTAO75443 2155 aa27.13■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 BPTFQ12830 3046 aa27.13■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAD51BO15315 384 aa27.13■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTX2O75431 263 aa27.13■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR56A5P0C7T3 313 aa27.13■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT4P19013 534 aa27.13■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 CRABP2P29373 138 aa27.13■■□□□ 1.93
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CTDNEP1-201ENST00000318988 EXOC3L1Q86VI1 746 aa27.13■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf210Q8IVY1 113 aa27.13■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACMSDQ8TDX5 336 aa27.13■■□□□ 1.93
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS2R13Q9NYV9 303 aa27.13■■□□□ 1.93
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA8RI6L899 631 aa27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 VPS26AO75436 327 aa27.12■■□□□ 1.93
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB10P61026 200 aa27.12■■□□□ 1.93
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSSK4Q6SA08 328 aa27.12■■□□□ 1.93
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SNX19Q92543 992 aa27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 CABS1Q96KC9 395 aa27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSSK1BQ9BXA7 367 aa27.12■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM39Q9HCM9 518 aa27.12■■□□□ 1.93
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MACC1Q6ZN28 852 aa27.11■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 DET1Q7L5Y6 550 aa27.11■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM74Q86UV6 250 aa27.11■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 C4orf33Q8N1A6 199 aa27.11■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM105Q8N8V8 129 aa27.11■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 CADM4Q8NFZ8 388 aa27.11■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 ISL2Q96A47 359 aa27.11■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CTDNEP1-201ENST00000318988 BIRC7Q96CA5 298 aa27.11■■□□□ 1.93
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