RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317221.11

ZNF559-201, Transcript of zinc finger protein 559, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ZNF559, Length 2,732 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559-201ENST00000317221 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 PXMP2Q9NR77 195 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 TOR4AQ9NXH8 423 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 DPP3Q9NY33 737 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 STMN3Q9NZ72 180 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa5.69□□□□□ -1.5
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ZNF559-201ENST00000317221 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 STAP1Q9ULZ2 295 aa5.69□□□□□ -1.5
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ZNF559-201ENST00000317221 A8MV72 311 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 MSCO60682 206 aa5.69□□□□□ -1.5
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ZNF559-201ENST00000317221 PRSS23O95084 383 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 CD4P01730 458 aa5.69□□□□□ -1.5
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ZNF559-201ENST00000317221 GRIK1P39086 918 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 CASP2P42575 452 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 MTHFRP42898 656 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 BCAT1P54687 386 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 TRAF3Q13114 568 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 ACOX1Q15067 660 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 BRMS1LQ5PSV4 323 aa5.69□□□□□ -1.5
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ZNF559-201ENST00000317221 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF470Q6ECI4 717 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 SULT1C3Q6IMI6 304 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF280DQ6N043 979 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 PRR23CQ6ZRP0 262 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.69□□□□□ -1.5
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ZNF559-201ENST00000317221 PROSER1Q86XN7 944 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 UBQLNLQ8IYU4 475 aa5.69□□□□□ -1.5
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ZNF559-201ENST00000317221 CLYBLQ8N0X4 340 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 DEPDC4Q8N2C3 294 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 CNIH3Q8TBE1 160 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 FRS2Q8WU20 508 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 CCDC126Q96EE4 140 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 C19orf60Q96EN9 201 aa5.69□□□□□ -1.5
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ZNF559-201ENST00000317221 TTYH2Q9BSA4 534 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 FEM1AQ9BSK4 669 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 MUC13Q9H3R2 512 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 UBP1Q9NZI7 540 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 OPTCQ9UBM4 332 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 SIX4Q9UIU6 781 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 CITO14578 2027 aa5.69□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 A0A1W2PP18 115 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 UNCXA6NJT0 531 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 EFCAB9A8MZ26 197 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 GNGT2O14610 69 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 AP3D1O14617 1153 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 HAT1O14929 419 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 B4GALT4O60513 344 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 TMCC2O75069 709 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 CNTN5O94779 1100 aa5.68□□□□□ -1.5
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ZNF559-201ENST00000317221 ITGB3P05106 788 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 NR3C2P08235 984 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 CCDC159P0C7I6 412 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 IMPDH1P20839 514 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 GGT5P36269 586 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 NDST1P52848 882 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 SLC12A2P55011 1212 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 CDH13P55290 713 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 OR4D2P58180 307 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF45Q02386 682 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 CHRNB3Q05901 458 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 CAPSQ13938 189 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 DUSP7Q16829 419 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 UGP2Q16851 508 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 Q5BKY6 102 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 PAGE3Q5JUK9 113 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF484Q5JVG2 852 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 NXNL2Q5VZ03 156 aa5.68□□□□□ -1.5
ZNF559-201ENST00000317221 JADE1Q6IE81 842 aa5.68□□□□□ -1.5
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