RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC4A11Q8NBS3 891 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 EXD2Q9NVH0 621 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 SALL4Q9UJQ4 1053 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 AKR1D1P51857 326 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CLCQ05315 142 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 USP41Q3LFD5 358 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 PARP15Q460N3 678 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 AGPSO00116 658 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ELFN1P0C7U0 828 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 EVX2Q03828 476 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CARTPTQ16568 116 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 AGAP2Q99490 1192 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 SP140LQ9H930 580 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ATRNO75882 1429 aa24.01■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 SMCO1Q147U7 214 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 HEXDCQ8WVB3 486 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR21Q99679 349 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ACAT2Q9BWD1 397 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 TULP3O75386 442 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CD52P31358 61 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 RFWD3Q6PCD5 774 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 PAOXQ6QHF9 649 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 LGR5O75473 907 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 SSR2P43308 183 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 TMPRSS11BQ86T26 416 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ROPN1LQ96C74 230 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 EBF3Q9H4W6 596 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 TULP2O00295 520 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 SCN2BO60939 215 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ICAM3P32942 547 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 BRCC3P46736 316 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 FUT2Q10981 343 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CXorf21Q9HAI6 301 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 PFDN2Q9UHV9 154 aa24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CARNS1A5YM72 827 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CLDN9O95484 217 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 NR4A1P22736 598 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM92BQ6ZTR7 304 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 BEND5Q7L4P6 421 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 MTFR1LQ9H019 292 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 IPPKQ9H8X2 491 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 FADS2P1A8MWK0 482 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJA2O60884 412 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 GCATO75600 419 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 MPPE1Q53F39 396 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 LCN1P1Q5VSP4 162 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC36Q8IYA8 594 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 C5orf60A6NFR6 353 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CD48P09326 243 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 UROSP10746 265 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ASMTP46597 345 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ARFIP1P53367 373 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP2R2BQ00005 443 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 BTN2A3PQ96KV6 586 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 EQTNQ9NQ60 294 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 TRPS1Q9UHF7 1281 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 TCAF1Q9Y4C2 921 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 C9orf64Q5T6V5 341 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 KCTD8Q6ZWB6 473 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 C17orf64Q86WR6 236 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 SVOPLQ8N434 492 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CERKQ8TCT0 537 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 AP2M1Q96CW1 435 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 UBR7Q8N806 425 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 NODALQ96S42 347 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 TNKS2Q9H2K2 1166 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa23.99■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 DISP2A7MBM2 1401 aa23.98■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 CACNG1Q06432 222 aa23.98■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 LCP2Q13094 533 aa23.98■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 OR10G6Q8NH81 332 aa23.98■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF879B4DU55 563 aa23.98■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 E9PAM4 449 aa23.98■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 PLIN3O60664 434 aa23.98■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 ERN1O75460 977 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT33AO76009 404 aa23.98■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 S100A1P23297 94 aa23.98■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 MNDAP41218 407 aa23.98■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa23.98■■□□□ 1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 STX12Q86Y82 276 aa23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms