RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000078849.11

Gpc6-201, Transcript of Glypican-6, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gpc6, Length 1,668 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Krt73Q6NXH9 539 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Smpd4Q6ZPR5 823 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Fam107aQ78TU8 144 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Pnma8aQ80VM8 430 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 SvopQ8BFT9 548 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Lrrc8dQ8BGR2 859 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Serpinb9dQ8BMT0 377 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Sfr1Q8BP27 319 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 C5ar2Q8BW93 344 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 OsgepQ8BWU5 335 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Fmo9Q8C116 539 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Gm3411Q8C7R2 150 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Cfap61Q8CEL2 1252 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Nox1Q8CIZ9 591 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Sirt5Q8K2C6 310 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Vmn1r205Q8R276 316 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Adgrf1Q8VEC3 908 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Nsmce2Q91VT1 247 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 NlnQ91YP2 704 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Taf11Q99JX1 211 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Pinx1Q9CZX5 332 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Toe1Q9D2E2 511 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Slco6d1Q9D5W6 683 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Gid8Q9D7M1 228 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Dusp6Q9DBB1 381 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 ScelQ9EQG3 652 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Chek2Q9Z265 546 aa14.65□□□□□ -0.06
Gpc6-201ENSMUST00000078849 PtprdQ64487 1912 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Erich2E9Q1A6 463 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Prdx3P20108 257 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Fdft1P53798 416 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 E2f2P56931 443 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Ap1s1P61967 158 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Traf6P70196 530 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Eps8Q08509 821 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Mdga1Q0PMG2 940 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Zfp560Q3URI6 754 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Zfp868Q3UTQ6 422 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Eps15l1Q60902 907 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Pde1aQ61481 565 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Kirrel1Q80W68 789 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Fam109aQ8BH49 266 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Prdm8Q8BZ97 687 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 TpbglQ8C013 384 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 SntnQ8C9X1 147 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 B3galt6Q91Z92 325 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Slc35b2Q91ZN5 431 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 AasdhpptQ9CQF6 309 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Rnf146Q9CZW6 359 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 S100pbpQ9D5K4 396 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 PyglQ9ET01 850 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Prl5a1Q9JII2 230 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Cyhr1Q9QXA1 311 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Pkp3Q9QY23 797 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Cyb561d2Q9WUE3 222 aa14.64□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Ighg3A0A1Y7VJN6 399 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Vmn1r3A2AMT7 306 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Ttc23lA6H6E9 458 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Itm2bO89051 266 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 ClgnP52194 611 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 NcanP55066 1268 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Pip5k1bP70181 539 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 LcorlQ3U285 600 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Parp3Q3ULW8 533 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Foxr1Q3UTB7 268 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Il17aQ62386 158 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Rps27lQ6ZWY3 84 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Q8R1Y2 203 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Vmn1r213Q8R278 384 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Vmn1r79Q8R285 306 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Chchd4Q8VEA4 139 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Mapk8Q91Y86 384 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Oas1cQ924S2 362 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Cers2Q924Z4 380 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Pacsin3Q99JB8 424 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Cmc1Q9CPZ8 106 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Ndufaf4Q9D1H6 173 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Mkrn2Q9ERV1 416 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 NfkbizQ9EST8 728 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Cog8Q9JJA2 640 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Il22bQ9JJY8 179 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Dclk1Q9JLM8 756 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Cdh13Q9WTR5 714 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Rps6kb2Q9Z1M4 485 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Dio2Q9Z1Y9 266 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Baz2bA2AUY4 2123 aa14.63□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Vsig10l2A0A140LHF2 776 aa14.62□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Vmn2r73D3Z7M3 851 aa14.62□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Neurod4O09105 330 aa14.62□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Stc1O55183 247 aa14.62□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Grpel2O88396 224 aa14.62□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Itgb1P09055 798 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Ppp3ccP48455 513 aa14.62□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Mkl2P59759 1080 aa14.62□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Arf5P84084 180 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Krt80Q0VBK2 452 aa14.62□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Coq10bQ3THF9 240 aa14.62□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Gpsm3Q3U1Z5 159 aa14.62□□□□□ -0.07
Gpc6-201ENSMUST00000078849 Esrp1Q3US41 680 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.2 ms