RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077853.4

Prpf4b-201, Transcript of Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prpf4b, Length 7,844 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Padi4Q9Z183 666 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fam151bD3YUE4 279 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Hsd17b10O08756 261 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Got2P05202 430 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Impdh1P50096 514 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Traf6P70196 530 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Slc16a10Q3U9N9 512 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Btg1-ps1Q3V0S2 161 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Btg1-ps2Q3V0X0 161 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cxxc5Q91WA4 317 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ptbp2Q91Z31 531 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ndfip2Q91ZP6 311 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Bcas2Q9D287 225 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Spin2-ps6A0A140T8V2 174 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm7945F6QI24 236 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 TazI7HJS2 263 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tpst2O88856 376 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 DcnP28654 354 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gad2P48320 585 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Oaz1P54369 227 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm9758Q80ZT2 255 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 SowahaQ8BLS7 548 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Casp9Q8C3Q9 454 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Il36gQ8R460 164 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Micu1Q8VCX5 477 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr1353Q8VGU8 309 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Yaf2Q99LW6 179 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Trim8Q99PJ2 551 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Exoc2Q9D4H1 924 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tlr6Q9EPW9 795 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Myo5cE9Q1F5 1742 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ism2D3Z6A3 493 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Kifc5bE9PUA5 672 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 GnazO70443 355 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Syt4P40749 425 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 PomkQ3TUA9 349 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Q3UST5 385 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Amigo2Q80ZD9 519 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Crls1Q80ZM8 303 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Vgll2Q8BGW8 322 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ddx52Q8K301 598 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Uroc1Q8VC12 676 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fabp12Q9DAK4 132 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Wdr95D3Z7A8 784 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Zfp275G3X904 499 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Mmp3P28862 477 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Hnf4aP49698 474 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Polr2lP62876 67 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Trit1Q80UN9 467 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Xylt1Q811B1 953 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Thap1Q8CHW1 210 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Nle1Q8VEJ4 485 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 PglsQ9CQ60 257 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Wdr55Q9CX97 388 aa8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Mfsd10Q9D2V8 456 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Mrpl19Q9D338 292 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 A0A286YDU1 74 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 4930558K02RikE0CXC6 182 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Serpine3E9Q6A2 401 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm3642K7N6V4 267 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Zw10O54692 779 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Lrig1P70193 1091 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 PterQ60866 349 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tm4sf1Q64302 202 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cypt2Q6P924 180 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rdh12Q8BYK4 316 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 RhoqQ8R527 205 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Arhgef25Q9CWR0 618 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Spef2Q8C9J3 1734 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Gm4846B2RWH8 538 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Sema3aO08665 772 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Slc10a3P21129 473 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ctps1P70698 591 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Jak2Q62120 1129 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ndrg1Q62433 394 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ntan1Q64311 310 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ints6Q6PCM2 883 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Olfr299Q7TS05 330 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Fnip2Q80TD3 1108 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Kctd2Q8CEZ0 266 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Serpina11Q8CIE0 424 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Saysd1Q8K190 188 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ubqln1Q8R317 582 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Pofut2Q8VHI3 429 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Exosc4Q921I9 245 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 EbplQ9D0P0 206 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Q9D4W2 315 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Subh2bvQ9D9Z7 123 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ccr10Q9JL21 362 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Cdh22Q9WTP5 813 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ddx43D3Z6P9 646 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Adamts14E9PX39 1209 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Agtr2P35374 363 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Mkl2P59759 1080 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Rnf157Q3TEL6 685 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Etaa1Q5SVT3 877 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tmem151bQ68FE7 561 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ube2r2Q6ZWZ2 238 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Ubp1Q811S7 540 aa8.69□□□□□ -1.02
Prpf4b-201ENSMUST00000077853 Tbc1d14Q8CGA2 694 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.2 ms