RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif4ebp2P70445 120 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Colec11Q3SXB8 272 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4981Q3ULJ8 291 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm44Q3V089 1013 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nr1h2Q60644 446 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 StyxQ60969 223 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ssx9Q6XAS3 170 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smpd4Q6ZPR5 823 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syt14Q7TN84 555 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ints7Q7TQK1 966 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr297Q7TS07 310 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr139Q80UC8 345 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpina3nQ91WP6 418 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fcf1Q9CTH6 198 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdyl2Q9D5D8 503 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2c55Q9D816 490 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IgtpQ9DCE9 423 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cacng3Q9JJV5 315 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spag6Q9JLI7 507 aa12.59□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DmdP11531 3678 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv11-1A0A075B5R6 117 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm12248A0A1W2P8B8 313 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sult1e1P49891 295 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyb5r2Q3KNK3 276 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam131bQ3TY60 332 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GpamQ61586 827 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekhs1Q8BW88 474 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nmur2Q8BZ39 395 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TbcelQ8C5W3 424 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nol6Q8R5K4 1152 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps11Q91W86 941 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elmod3Q91YP6 381 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp6v1g1Q9CR51 118 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prpsap1Q9D0M1 356 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps28Q9D1C8 221 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Efcab9Q9DAM2 216 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kat2bQ9JHD1 813 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan4eA0A1B0GRE8 505 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3259D3YUK0 475 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nsmce4aG3XA30 381 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r5K7N788 911 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sema3aO08665 772 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GzmkO35205 263 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dync1i2O88487 612 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nfkb1P25799 971 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl26P61255 145 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700061G19RikQ08EE8 705 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc45a4Q0P5V9 785 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Micall2Q3TN34 1009 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam83fQ3UKU4 495 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem102Q3UPR7 509 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam189bQ5HZJ5 669 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dennd2cQ6P9P8 914 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scd4Q6T707 353 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trnau1apQ80VC6 287 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tecpr1Q80VP0 1166 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zmpste24Q80W54 475 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcid2Q8BFV2 399 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elmo2Q8BHL5 732 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap28Q8BN58 729 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sfrp1Q8C4U3 314 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tceal5Q8CCT4 200 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dennd1cQ8CFK6 786 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mat2bQ99LB6 334 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf146Q9CZW6 359 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dpysl5Q9EQF6 564 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pias4Q9JM05 507 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abhd1Q9QZC8 412 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stau1Q9Z108 487 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zscan12Q9Z1D7 501 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pld1Q9Z280 1074 aa12.58□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IsxA1A546 240 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm14401A2ARV7 303 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox2gL7MUB9 191 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psma3O70435 255 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mapkapk2P49138 386 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prickle1Q3U5C7 832 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Grxcr1Q50H32 290 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtmr12Q80TA6 747 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc44a2Q8BY89 706 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ston2Q8BZ60 895 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pnpla8Q8K1N1 776 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DcxrQ91X52 244 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HnrnpllQ921F4 591 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ska2Q9CR46 120 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfaip8l2Q9D8Y7 184 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnft1Q9DCN7 395 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RhojQ9ER71 214 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtsjQ9R014 334 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il18rapQ9Z2B1 614 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp472B0V2W5 534 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akap5D3YVF0 745 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6351K9J7D1 481 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CskP41241 450 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Resp18P47939 175 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd244Q07763 397 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrlrQ08501 608 aa12.57□□□□□ -0.4
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap17Q3UIA2 846 aa12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23 ms