RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN11	O75508	207 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	BAIAP3	O94812	1187 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	STAMBP	O95630	424 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	CLPTM1	O96005	669 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	C1R	P00736	705 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM18	P0DKX4	95 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	BMP1	P13497	986 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	CR2	P20023	1033 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	ATP6V1B2	P21281	511 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	TAF12	Q16514	161 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	TEX37	Q96LM6	180 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC160	A6NGH7	325 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152		E5RI56	91 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	ARVCF	O00192	962 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	TRAF2	Q12933	501 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	FUT11	Q495W5	492 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	LINGO1	Q96FE5	620 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	HGH1	Q9BTY7	390 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	CD274	Q9NZQ7	290 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF225	Q9UK10	706 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		13	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	FAM149A	A5PLN7	773 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	SEC24A	O95486	1093 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	PRAMEF12	O95522	483 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	CTPS1	P17812	591 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	UGT1A6	P19224	532 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	ARF5	P84085	180 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	PLD1	Q13393	1074 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	LHX8	Q68G74	356 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	SYVN1	Q86TM6	617 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	SNX2	O60749	519 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	VPS26A	O75436	327 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	TMCC1	O94876	653 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	TFAP2A	P05549	437 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	PYGL	P06737	847 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	SLC7A1	P30825	629 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	ATP4B	P51164	291 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	HK3	P52790	923 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	C5orf22	Q49AR2	442 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	PAF1	Q8N7H5	531 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	ROPN1L	Q96C74	230 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	PIF1	Q9H611	641 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GVM2	712 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	ILVBL	A1L0T0	632 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	SYCE1L	A8MT33	242 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	GIPC1	O14908	333 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	ALDH1A1	P00352	501 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	PSMC3	P17980	439 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	ITGB6	P18564	788 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	CCL23	P55773	120 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	ATP6V0D1	P61421	351 aa		12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
BRF1-222	ENST00000635152	IKBKE	Q14164	716 aa		12.99	□□□□□ -0.33

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