RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623047.1

CU638689.4-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CU638689.4, Length 5,990 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU638689.4-201ENST00000623047 CDK16Q00536 496 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 SGCBQ16585 318 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 HECTD2Q5U5R9 776 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 IKBIPQ70UQ0 350 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 CRLF3Q8IUI8 442 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 DEFB106AQ8N104 65 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 DEFB124Q8NES8 71 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 THAP4Q8WY91 577 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 NCSTNQ92542 709 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 VPS11Q9H270 941 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 RAB9BQ9NP90 201 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 GLS2Q9UI32 602 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.58□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 NAV1Q8NEY1 1877 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 ESYT3A0FGR9 886 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 TLR4O00206 839 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 KLK10O43240 276 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 B3GALT2O43825 422 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 SP9P0CG40 484 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 IMPDH2P12268 514 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 IL9P15248 144 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 ALAS2P22557 587 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 PBX3P40426 434 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 OCRLQ01968 901 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 TRIM51Q9BSJ1 452 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 TPSD1Q9BZJ3 242 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 HEBP1Q9NRV9 189 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 SYBUQ9NX95 663 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 DTNAQ9Y4J8 743 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 TMEM114B3SHH9 223 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 TNFRSF10CO14798 259 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 MUSKO15146 869 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 PI15O43692 258 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 LPLP06858 475 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 COL6A2P12110 1019 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 CASP5P51878 434 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 FAM83EQ2M2I3 478 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 TAS2R13Q9NYV9 303 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 WDR91A4D1P6 747 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 COQ9O75208 318 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 PROSCO94903 275 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 ASGR2P07307 311 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 ADRB2P07550 413 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 RBP1P09455 135 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 LIMK1P53667 647 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 ARL9Q6T311 187 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 ACAD11Q709F0 780 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 CACUL1Q86Y37 369 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 PHF11Q9UIL8 331 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 MYH3P11055 1940 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 KCNU1A8MYU2 1149 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 TPP1O14773 563 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 UGT2B4P06133 528 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 GGCXP38435 758 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 PRKAA2P54646 552 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 ITIH4Q14624 930 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 CBWD6Q4V339 395 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 C22orf39Q6P5X5 142 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 CYP4Z1Q86W10 505 aa7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CU638689.4-201ENST00000623047 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms