RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2J2Q8N2K1 259 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 DNERQ8NFT8 737 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 HASPINQ8TF76 798 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ARNTL2Q8WYA1 636 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SLC30A3Q99726 388 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 CMTM6Q9NX76 183 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 GMIPQ9P107 970 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 CSADQ9Y600 493 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TTC3P53804 2025 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TSC22D2O75157 780 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 PIGRP01833 764 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 AKAP5P24588 427 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ADCYAP1R1P41586 468 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SNTA1Q13424 505 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 LIPMQ5VYY2 423 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TRNP1Q6NT89 227 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 USP51Q70EK9 711 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 C7orf57Q8NEG2 295 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TRPV3Q8NET8 790 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 RDH11Q8TC12 318 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 SEPT1Q8WYJ6 367 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 GTF2H4Q92759 462 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 MUL1Q969V5 352 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 CDCA5Q96FF9 252 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 VMP1Q96GC9 406 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 NODALQ96S42 347 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 TLK1Q9UKI8 766 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 CFAP54Q96N23 3096 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TSPAN4O14817 238 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 AKR7A2O43488 359 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 NDST3O95803 873 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 HOXC6P09630 235 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 GFAPP14136 432 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CYP3A5P20815 502 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 RFC2P35250 354 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SERPINB10P48595 397 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 BEX3Q00994 111 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ENPEPQ07075 957 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TUBA3CQ13748 450 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SURF1Q15526 300 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TBC1D21Q8IYX1 336 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 OR52K1Q8NGK4 314 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PHF21BQ96EK2 531 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SP140LQ9H930 580 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PGLSO95336 258 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CTSHP09668 335 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CYP4B1P13584 511 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 IL4RP24394 825 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 GPD2P43304 727 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 MAGEA3P43357 314 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SLC9A3P48764 834 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 DAB2P98082 770 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 CDC20Q12834 499 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 SLAMF1Q13291 335 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 PPIL2Q13356 520 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 INSCQ1MX18 579 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 BCL7AQ4VC05 210 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 BRMS1LQ5PSV4 323 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 GALNT7Q86SF2 657 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRT-211ENST00000618610 P2RY8Q86VZ1 359 aa8.14□□□□□ -1.11
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