RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616247.4

LMO3-235, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 3,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-235ENST00000616247 TRAF3Q13114 568 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 TRIM60Q495X7 471 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 SMUG1Q53HV7 270 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 SGO1Q5FBB7 561 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 FRS2Q8WU20 508 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 FAR1Q8WVX9 515 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 HSFY1Q96LI6 401 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 DOK1Q99704 481 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 SH3GL1Q99961 368 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 MRGBPQ9NV56 204 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 DKK3Q9UBP4 350 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 FAM50BQ9Y247 325 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 A0A087X1B8 175 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 FAM20BO75063 409 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 RFPL2O75678 378 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 PIGAP37287 484 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 ALDH3A2P51648 485 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 TNFAIP2Q03169 654 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 PSMD5Q16401 504 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 ADPRMQ3LIE5 342 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 XAF1Q6GPH4 301 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 LCN8Q6JVE9 175 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 USP43Q70EL4 1123 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 SPRED1Q7Z699 444 aa6.63□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 PAF1Q8N7H5 531 aa6.63□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 FAM167AQ96KS9 214 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 COQ7Q99807 217 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 WDCPQ9H6R7 721 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 RGS18Q9NS28 235 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 SCN3BQ9NY72 215 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 KLHL3Q9UH77 587 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.63□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 VWA7Q9Y334 891 aa6.63□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 UTRNP46939 3433 aa6.63□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 KATNA1O75449 491 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CAPNS1P04632 268 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 USP17L7P0C7H9 530 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CYP2C8P10632 490 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 FMO4P31512 558 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 NPTX1Q15818 432 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 BCL2A1Q16548 175 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 TECRLQ5HYJ1 363 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 DESI1Q6ICB0 168 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 STRADAQ7RTN6 431 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 STON2Q8WXE9 905 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 WNT8BQ93098 351 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 TEX37Q96LM6 180 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 GPR78Q96P69 363 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 MYOCQ99972 504 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 BEX2Q9BXY8 128 aa6.63□□□□□ -1.35
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LMO3-235ENST00000616247 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 COMMD8Q9NX08 183 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-235ENST00000616247 IL37Q9NZH6 218 aa6.63□□□□□ -1.35
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