RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 LTBQ06643 244 aa11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 DBN1Q16643 649 aa11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 RABGAP1LQ5R372 815 aa11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 NAGSQ8N159 534 aa11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 CT55Q8WUE5 264 aa11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 RELTQ969Z4 430 aa11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ARHGEF26Q96DR7 871 aa11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 RNF31Q96EP0 1072 aa11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 CEP44Q9C0F1 390 aa11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ZWILCHQ9H900 591 aa11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 MCCC2Q9HCC0 563 aa11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ABCA4P78363 2273 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 KCNU1A8MYU2 1149 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 EXOC3O60645 756 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 SMIM24O75264 130 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 LCP1P13796 627 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 GUCY1A3Q02108 690 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 PNOCQ13519 176 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 SNX1Q13596 522 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ZNF235Q14590 738 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 INPP5AQ14642 412 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 LRRC14Q15048 493 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ZNF805Q5CZA5 627 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 VWA2Q5GFL6 755 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 LRRC73Q5JTD7 316 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD40Q6AI12 368 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 SHC4Q6S5L8 630 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 LCA5Q86VQ0 697 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 KCNMB4Q86W47 210 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 CCDC197Q8NCU1 140 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 OR56A4Q8NGH8 313 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 SLX1AQ9BQ83 275 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 YIPF3Q9GZM5 350 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 VCXQ9H320 206 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 SNX12Q9UMY4 172 aa11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 C19orf84I3L1E1 186 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 TNFRSF10CO14798 259 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ENDOD1O94919 500 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 PYGBP11216 843 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 CCNB1P14635 433 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 STAT1P42224 750 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 PAFAH1B1P43034 410 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 RPS18P62269 152 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 KIF5AQ12840 1032 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 AGERQ15109 404 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R7Q15435 360 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 MEA1Q16626 185 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 C5orf22Q49AR2 442 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 CROCCP2Q86T23 111 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 SYVN1Q86TM6 617 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ACBD4Q8NC06 268 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 TEKT4Q8WW24 435 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 LRRC45Q96CN5 670 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 DNAJC7Q99615 494 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 DNAI2Q9GZS0 605 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 MUC3BQ9H195 1237 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 CCDC134Q9H6E4 229 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 LHX9Q9NQ69 397 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 CISHQ9NSE2 258 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 TAAR2Q9P1P5 351 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ATXN10Q9UBB4 475 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 NEU2Q9Y3R4 380 aa11.61□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ANK2Q01484 3957 aa11.6□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ZGRF1Q86YA3 2104 aa11.6□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 A8MU76 341 aa11.6□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 O00370 1275 aa11.6□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 CLDN11O75508 207 aa11.6□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ZMPSTE24O75844 475 aa11.6□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 PYGLP06737 847 aa11.6□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD34CP0C6C1 535 aa11.6□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 EDN3P14138 238 aa11.6□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 NQO1P15559 274 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 DRD4P21917 467 aa11.6□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 GKP32189 559 aa11.6□□□□□ -0.55
HCG18-241ENST00000602290 PPP2R2AP63151 447 aa11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms