RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 RGSL1A5PLK6 1076 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 EFCAB8A8MWE9 144 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 C9orf172C9J069 976 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 APOL1O14791 398 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 EML2O95834 649 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 KRT1P04264 644 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 CFHR1Q03591 330 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 C19orf57Q0VDD7 668 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 AP1B1Q10567 949 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 MAP9Q49MG5 647 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 PHF19Q5T6S3 580 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 NPNTQ6UXI9 565 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 USP53Q70EK8 1073 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 JAMLQ86YT9 394 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 GALNT13Q8IUC8 556 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 ZNF843Q8N446 348 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 CEP112Q8N8E3 955 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 TRIM58Q8NG06 486 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 UBXN4Q92575 508 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 USP7Q93009 1102 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 FAM83DQ9H4H8 585 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 FOXJ2Q9P0K8 574 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 INTUQ9ULD6 942 aa13.19□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 BTNL10A8MVZ5 291 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 AGRPO00253 132 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 HGSO14964 777 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 ZW10O43264 779 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 PRAMEF10O60809 474 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 CSF2RBP32927 897 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 SLC1A1P43005 524 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 FASLGP48023 281 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 LIMK2P53671 638 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 GALNT3Q14435 633 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 PDK1Q15118 436 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 TGIF1Q15583 401 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 SLC14A2Q15849 920 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 TAZQ16635 292 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 NKAIN2Q5VXU1 208 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 MFSD7Q6UXD7 560 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 CCDC81Q6ZN84 652 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 NT5DC3Q86UY8 548 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 RHOT1Q8IXI2 618 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 SFRP1Q8N474 314 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 CCHCR1Q8TD31 782 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 SLC37A2Q8TED4 501 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 CCDC74BQ96LY2 380 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 ALS2CR12Q96Q35 445 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 ADGRE3Q9BY15 652 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 CEP41Q9BYV8 373 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 B3GNT4Q9C0J1 378 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 BRD8Q9H0E9 1235 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 SLC25A51Q9H1U9 297 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 PKD2L2Q9NZM6 624 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 PRKAB1Q9Y478 270 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 JRKLQ9Y4A0 524 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 HYOU1Q9Y4L1 999 aa13.18□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 A6NCN8 305 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 ASMTLO95671 621 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 THRAP10827 490 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 LIPCP11150 499 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 CCL4P13236 92 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 COMTP21964 271 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 NOP2P46087 812 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 MAPK10P53779 464 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 CDK18Q07002 472 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 TEX44Q53QW1 395 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 TMC3Q7Z5M5 1100 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 DTX1Q86Y01 620 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 RFX6Q8HWS3 928 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 RCBTB1Q8NDN9 531 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 OR4D9Q8NGE8 314 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 AGAP3Q96P47 875 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 RMI1Q9H9A7 625 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 MAGEE1Q9HCI5 957 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 SAR1BQ9Y6B6 198 aa13.17□□□□□ -0.3
CTIF-210ENST00000591412 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms