RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 PCSK1NQ9UHG2 260 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-205ENST00000588780 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 DNAJC6O75061 913 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 LDLRP01130 860 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 VIPP01282 170 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 C9P02748 559 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 SOX5P35711 763 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 EPHB1P54762 984 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 CAMK4Q16566 473 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 UGT8Q16880 541 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 CACHD1Q5VU97 1274 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 C1QL3Q5VWW1 255 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 MOCOSQ96EN8 888 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 RUFY1Q96T51 708 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 PDE7BQ9NP56 450 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 VPS18Q9P253 973 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC5A6Q9Y289 635 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 C2CD3Q4AC94 2353 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 FGF5P12034 268 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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CAPNS1-205ENST00000588780 FAM92BQ6ZTR7 304 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF765Q7L2R6 523 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 COX14Q96I36 57 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 GPR87Q9BY21 358 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 OGFRQ9NZT2 677 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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CAPNS1-205ENST00000588780 PTPN4P29074 926 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 PTSQ03393 145 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 ITKQ08881 620 aa21.49■■□□□ 1.03
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CAPNS1-205ENST00000588780 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 IRGCQ6NXR0 463 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM26Q6ZUK4 368 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 PGBD5Q8N414 524 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 MLKLQ8NB16 471 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 SMIM14Q96QK8 99 aa21.49■■□□□ 1.03
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CAPNS1-205ENST00000588780 RARRES3Q9UL19 164 aa21.49■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 KRT86O43790 486 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF30P17039 623 aa21.48■■□□□ 1.03
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CAPNS1-205ENST00000588780 RHOT1Q8IXI2 618 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 TTC13Q8NBP0 860 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 PIH1D2Q8WWB5 315 aa21.48■■□□□ 1.03
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CAPNS1-205ENST00000588780 MLXIPLQ9NP71 852 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 KLC4Q9NSK0 619 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa21.48■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 WIPF3A6NGB9 483 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 A6NL46 340 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 GRID2O43424 1007 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 TIAF1O95411 115 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 PDHA1P08559 390 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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CAPNS1-205ENST00000588780 NLRP8Q86W28 1048 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 C19orf60Q96EN9 201 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 ZDHHC12Q96GR4 267 aa21.47■■□□□ 1.03
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CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa21.47■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 PDZK1P1A8MUH7 402 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF185O15231 689 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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CAPNS1-205ENST00000588780 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 RALGPS1Q5JS13 557 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 MARC1Q5VT66 337 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC6A19Q695T7 634 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa21.46■■□□□ 1.03
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