RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 CAMKK1Q8N5S9 505 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 STMN2Q93045 179 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 VWA7Q9Y334 891 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 CACNA1AO00555 2505 aa25.34■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP250Q9BV73 2442 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 E2F8A0AVK6 867 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC189A1A4V9 331 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 TRPC5OSA6NMA1 111 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 COCHO43405 550 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 ENTPD5O75356 428 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 RPP40O75818 363 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 PIGNO95427 931 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMG1O95456 288 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 S1PR4O95977 384 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 GMPRP36959 345 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 ACVRL1P37023 503 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 PXNP49023 591 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 HECTD2Q5U5R9 776 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 CNSTQ6PJW8 725 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 ULK2Q8IYT8 1036 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 RTKNQ9BST9 563 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.654e-11■□□□□ 10.6
CAPNS1-204ENST00000587718 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC8A2Q9UPR5 921 aa25.33■■□□□ 1.65
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP17A1P05093 508 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 TFEBP19484 476 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 SAT1P21673 171 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 SUOXP51687 545 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 NAGLUP54802 743 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 SPEM2Q0P670 501 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 DLG1Q12959 904 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 IHHQ14623 411 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 ACSBG2Q5FVE4 666 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 AAGABQ6PD74 315 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 SYT13Q7L8C5 426 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 HEXDCQ8WVB3 486 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIB3Q96RU7 358 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP97Q9P2B7 532 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 STOML2Q9UJZ1 356 aa25.32■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GVM2 712 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 TCAF2A6NFQ2 919 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 LRP3O75074 770 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CRTAMO95727 393 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 THRAP10827 490 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 OXCT1P55809 520 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 ACTR3P61158 418 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 MXRA7P84157 204 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 KLF10Q13118 480 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 DHCR24Q15392 516 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 ACTRT2Q8TDY3 377 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 HDAC10Q969S8 669 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 TCF12Q99081 682 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 K7EQS6 105 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 GRID2O43424 1007 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 FKBP6O75344 327 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC6A4P31645 630 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 NAA20P61599 178 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 NFKB2Q00653 900 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 ACCSLQ4AC99 568 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 RALGPS1Q5JS13 557 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 LSMEM2Q8N112 164 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 GAB3Q8WWW8 586 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 NACA2Q9H009 215 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CDYLQ9Y232 598 aa25.31■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CR2P20023 1033 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 MPSTP25325 297 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CPA2P48052 419 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC34A1Q06495 639 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 TYSND1Q2T9J0 566 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 PGM2L1Q6PCE3 622 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 JADE3Q92613 823 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF385DQ9H6B1 395 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 NDE1Q9NXR1 346 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa25.3■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 ANTXRLA6NF34 631 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 IPO13O94829 963 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
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