RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 A6NJ64 397 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM38O00635 465 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CXCL8P10145 99 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CPEP16870 476 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CAMK2BQ13554 666 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FUT10Q6P4F1 479 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ACOT1Q86TX2 421 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MCUQ8NE86 351 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF333Q96JL9 665 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GMLQ99445 158 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NPC1O15118 1278 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GSTA4O15217 222 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HDAC3O15379 428 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CYP26A1O43174 497 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 UNC5CO95185 931 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MLYCDO95822 493 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SERPINF2P08697 491 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 BMI1P35226 326 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KCNJ2P63252 427 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GCNT1Q02742 428 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 BCL2L1Q07817 233 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FAM26DQ5JW98 314 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SLC35B4Q969S0 331 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RFT1Q96AA3 541 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TOX2Q96NM4 488 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 THTPAQ9BU02 230 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CERS4Q9HA82 394 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CES2O00748 559 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SSNA1O43805 119 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MED24O75448 989 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PSMD10O75832 226 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DHFRP00374 187 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TFPTP0C1Z6 253 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SFTPCP11686 197 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 UGT2B15P54855 530 aa6.27□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KCNJ8Q15842 424 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FAM209AQ5JX71 171 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CRLF3Q8IUI8 442 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TREM1Q9NP99 234 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ABI3Q9P2A4 366 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.27□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 C4BP0C0L5 1744 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 LACTBL1A8MY62 500 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 B2RBV5 119 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PLK4O00444 970 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SLC37A4O43826 429 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PRNPP04156 253 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 S100A8P05109 93 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SNHG28P0DPA3 235 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ALDH4A1P30038 563 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TPMTP51580 245 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 C21orf58P58505 322 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ERVK-25P63136 954 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CCINQ13939 588 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF124Q15973 351 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 KANK2Q63ZY3 851 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DEF8Q6ZN54 512 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MON1AQ86VX9 555 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ING5Q8WYH8 240 aa6.27□□□□□ -1.41
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