RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548518.1

SLC8B1-205, Transcript of solute carrier family 8 member B1, human

TSL 4

Gene SLC8B1, Length 664 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC8B1-205	ENST00000548518	LMO7DN	F2Z398	122 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	SMAP	O00193	183 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	LDB2	O43679	373 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	CDK14	O94921	469 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	MSH3	P20585	1137 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	AKT1	P31749	480 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	MC4R	P32245	332 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	PRAME	P78395	509 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	KCNJ11	Q14654	390 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	CHRNA6	Q15825	494 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	ARMC3	Q5W041	872 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	SNX20	Q7Z614	316 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	SLC25A45	Q8N413	288 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	KIF18A	Q8NI77	898 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	OR2AG1	Q9H205	316 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	SMOX	Q9NWM0	555 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	KLF15	Q9UIH9	416 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	CDC23	Q9UJX2	597 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	KCTD3	Q9Y597	815 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SLC8B1-205	ENST00000548518	LRP4	O75096	1905 aa		11.9	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518		H7C0S8	307 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	GRID2	O43424	1007 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	SIGLEC6	O43699	453 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	NUAK1	O60285	661 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	CBFA2T3	O75081	653 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	CDK4	P11802	303 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	MLN	P12872	115 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	VCL	P18206	1134 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	GRIA1	P42261	906 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	MAGEA6	P43360	314 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	POLD2	P49005	469 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	NFATC2	Q13469	925 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	BIRC2	Q13490	618 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	CCDC38	Q502W7	563 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	PYCR3	Q53H96	274 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	CASC4	Q6P4E1	433 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	HOOK3	Q86VS8	718 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	JAML	Q86YT9	394 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	BBOF1	Q8ND07	529 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	MCU	Q8NE86	351 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	CPT1B	Q92523	772 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	KRT12	Q99456	494 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	GPR34	Q9UPC5	381 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	MAGEB16	A2A368	324 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	CCDC78	A2IDD5	438 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	FAM187A	A6NFU0	413 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	MROH6	A6NGR9	719 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518		F8W8V4	182 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	KMO	O15229	486 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	FANCG	O15287	622 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	YY2	O15391	372 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	UGT1A9	O60656	530 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	TRIM16	O95361	564 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	SLC2A4	P14672	509 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	CKMT2	P17540	419 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	PAM	P19021	973 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	UGT1A6	P19224	532 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	UGT1A1	P22309	533 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	UGT1A4	P22310	534 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	UGT1A3	P35503	534 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SLC8B1-205	ENST00000548518	UGT1A5	P35504	534 aa		11.88	□□□□□ -0.51

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