RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP70Q8NHQ1 597 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ACTRT2Q8TDY3 377 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CLEC1BQ9P126 229 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO10Q9UK96 956 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.14■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 FZD6O60353 706 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT36O76013 467 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 HERVK_113P63132 956 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAM15Q13444 863 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC6Q16204 474 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF678Q5SXM1 525 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 C1orf146Q5VVC0 180 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 C12orf40Q86WS4 652 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNV2Q8TDN2 545 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD27Q96NW4 1050 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ERVK-6Q9BXR3 956 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PRO3102Q9H379 93 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 GSTO2Q9H4Y5 243 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF385DQ9H6B1 395 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.13■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 SDHDO14521 159 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 SUPT7LO94864 414 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PYGLP06737 847 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ACTR3P61158 418 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 RAD51Q06609 339 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 GEN1Q17RS7 908 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM136AQ96C01 138 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CATSPER2Q96P56 530 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PANX3Q96QZ0 392 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF576Q9H609 170 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM50BQ9Y247 325 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PKP3Q9Y446 797 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 H7C0S8 307 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CISD3P0C7P0 127 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ITGAXP20702 1163 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPRNQ16849 979 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ARMC12Q5T9G4 340 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 DERL2Q9GZP9 239 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 MRGBPQ9NV56 204 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 GDE1Q9NZC3 331 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 FIS1Q9Y3D6 152 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 COL4A3Q01955 1670 aa20.12■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ADH5P11766 374 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CSNK1DP48730 415 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP6V0D1P61421 351 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 BTKQ06187 659 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 MESP2Q0VG99 397 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 OR4D1Q15615 310 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 GAB4Q2WGN9 574 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM198Q66K66 360 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PAQR3Q6TCH7 311 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PIANPQ8IYJ0 282 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 EXT2Q93063 718 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ASB2Q96Q27 587 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 S1PR5Q9H228 398 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 EBF3Q9H4W6 596 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 MEAF6Q9HAF1 191 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEE1Q9HCI5 957 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 MED16Q9Y2X0 877 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.11■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A0U1RQS6 177 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 H3BMM5 538 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PGLSO95336 258 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PKMP14618 531 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC34A1Q06495 639 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PEX6Q13608 980 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 HERC3Q15034 1050 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 UNC50Q53HI1 259 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX32Q86XE0 403 aa20.1■□□□□ 0.81
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