RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 GNG2P59768 71 aa10.05□□□□□ -0.8
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TRPS1-211ENST00000520276 DUSP4Q13115 394 aa10.05□□□□□ -0.8
TRPS1-211ENST00000520276 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R3AQ16821 1122 aa10.05□□□□□ -0.8
TRPS1-211ENST00000520276 GEN1Q17RS7 908 aa10.05□□□□□ -0.8
TRPS1-211ENST00000520276 STXBP5Q5T5C0 1151 aa10.05□□□□□ -0.8
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF773Q6PK81 442 aa10.05□□□□□ -0.8
TRPS1-211ENST00000520276 OTOP3Q7RTS5 596 aa10.05□□□□□ -0.8
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TRPS1-211ENST00000520276 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa10.05□□□□□ -0.8
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TRPS1-211ENST00000520276 UBA3Q8TBC4 463 aa10.05□□□□□ -0.8
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TRPS1-211ENST00000520276 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
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TRPS1-211ENST00000520276 SLC7A14Q8TBB6 771 aa10.04□□□□□ -0.8
TRPS1-211ENST00000520276 RIPOR3Q96MK2 946 aa10.04□□□□□ -0.8
TRPS1-211ENST00000520276 MUS81Q96NY9 551 aa10.04□□□□□ -0.8
TRPS1-211ENST00000520276 CITED4Q96RK1 184 aa10.04□□□□□ -0.8
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM62Q9BVG3 475 aa10.04□□□□□ -0.8
TRPS1-211ENST00000520276 RAB6CQ9H0N0 254 aa10.04□□□□□ -0.8
TRPS1-211ENST00000520276 ASAH2Q9NR71 780 aa10.04□□□□□ -0.8
TRPS1-211ENST00000520276 MTMR10Q9NXD2 777 aa10.04□□□□□ -0.8
TRPS1-211ENST00000520276 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
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