RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 CARD9Q9H257 536 aa24.42■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 TBC1D29Q9UFV1 150 aa24.42■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 DCDC1P59894 354 aa24.41■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 SLC14A2Q15849 920 aa24.41■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 FAM182AQ5T1J6 154 aa24.41■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa24.41■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 EID2BQ96D98 161 aa24.41■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa24.41■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 SLC25A51Q9H1U9 297 aa24.41■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 SHOC2Q9UQ13 582 aa24.41■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF711Q9Y462 761 aa24.41■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa24.41■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa24.41■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 CFAP46Q8IYW2 2715 aa24.41■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 SDK2Q58EX2 2172 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 GRID2O43424 1007 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 NUAK1O60285 661 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 SNX2O60749 519 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 PIRTP0C851 137 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 TNNT1P13805 278 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 CDK18Q07002 472 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 NFATC2Q13469 925 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 IYDQ6PHW0 289 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 SLC9B2Q86UD5 537 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 CNGA4Q8IV77 575 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 ART4Q93070 314 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 PMEPA1Q969W9 287 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 SH3KBP1Q96B97 665 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 TSPY26PQ9H489 355 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 MAGEE1Q9HCI5 957 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 RAD18Q9NS91 495 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 ATXN10Q9UBB4 475 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 INTUQ9ULD6 942 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 COL6A6A6NMZ7 2263 aa24.4■■□□□ 1.5
ALYREF-203ENST00000511412 A6NCN8 305 aa24.39■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 SPOPO43791 374 aa24.39■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 F3P13726 295 aa24.39■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 ATP1A2P50993 1020 aa24.39■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa24.39■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 FAM129CQ86XR2 697 aa24.39■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 TRAM1L1Q8N609 369 aa24.39■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 GPR26Q8NDV2 337 aa24.39■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 TADA1Q96BN2 335 aa24.39■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 DDA1Q9BW61 102 aa24.39■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 GPR63Q9BZJ6 419 aa24.39■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 ARFGAP3Q9NP61 516 aa24.39■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 HYOU1Q9Y4L1 999 aa24.39■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF462Q96JM2 2506 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 A0A0G2JNG1 304 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 GPR89AB7ZAQ6 455 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 KIR2DS3K7RE56 304 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 ITGB2P05107 769 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 GPR89BP0CG08 455 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 ARSDP51689 593 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 KIR2DS5Q14953 304 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 PDPK2PQ6A1A2 396 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 MFSD7Q6UXD7 560 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 TMC3Q7Z5M5 1100 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 AVL9Q8NBF6 648 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 SPATA22Q8NHS9 363 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 OR2AG1Q9H205 316 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 GLOD4Q9HC38 313 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 SLC39A1Q9NY26 324 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 ADGRG1Q9Y653 693 aa24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 OR5K4A6NMS3 321 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 EFCAB7A8K855 629 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 B8ZZF3 427 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 COMTP21964 271 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 EPHA4P54764 986 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 RAB15P59190 212 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 TCEAL1Q15170 157 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 TEX44Q53QW1 395 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 SNAP47Q5SQN1 464 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 RNF214Q8ND24 703 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 GLYATL1Q969I3 302 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM39Q9HCM9 518 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 OCIAD1Q9NX40 245 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 PDP2Q9P2J9 529 aa24.37■■□□□ 1.49
ALYREF-203ENST00000511412 B4E171 279 aa24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms