RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504788.5

LMNB1-208, Transcript of lamin B1, human

TSL 2

Gene LMNB1, Length 1,801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMNB1-208	ENST00000504788	CAV1	Q03135	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	OVGP1	Q12889	678 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	ACOX1	Q15067	660 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	LPAL2	Q16609	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	TEX35	Q5T0J7	233 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	BBOF1	Q8ND07	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	RUBCN	Q92622	972 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	TCEAL3	Q969E4	200 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	GLYATL1	Q969I3	302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	MYOC	Q99972	504 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	BOC	Q9BWV1	1114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	P2RY12	Q9H244	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	PIEZO1	Q92508	2521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788		A0A1B0GTW7	788 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788		A6NCN8	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	FAM159B	A6NKW6	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788		A6NNZ2	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	NEMP1	O14524	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	TOR1B	O14657	336 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	NUAK1	O60285	661 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	OR1I1	O60431	355 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	NDUFS2	O75306	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	VAPB	O95292	243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	S1PR4	O95977	384 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	RET	P07949	1114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	ZNF806	P0C7X5	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	ACRV1	P26436	265 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	CD38	P28907	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	MC4R	P32245	332 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	MPL	P40238	635 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	HADHA	P40939	763 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	MAGEA4	P43358	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	RXRG	P48443	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	ARL4C	P56559	192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	IRX4	P78413	519 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	TMPRSS15	P98073	1019 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	GBX1	Q14549	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	NFATC4	Q14934	902 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	DBN1	Q16643	649 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	KYNU	Q16719	465 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMNB1-208	ENST00000504788	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms