RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF778	Q96MU6	729 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	YME1L1	Q96TA2	773 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	AGAP2	Q99490	1192 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	APOL2	Q9BQE5	337 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF38	Q9H0F5	515 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	NT5M	Q9NPB1	228 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SAR1A	Q9NR31	198 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	THAP1	Q9NVV9	213 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	COPG2	Q9UBF2	871 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	EBF1	Q9UH73	591 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	HAO1	Q9UJM8	370 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MID2	Q9UJV3	735 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CHKB	Q9Y259	395 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	INSL6	Q9Y581	213 aa		5.56	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SCN5A	Q14524	2016 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A087X1B8	175 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A096LPK6	155 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247		A0A0D9SEW6	157 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC189	A1A4V9	331 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	C2orf78	A6NCI8	922 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM114	B3SHH9	223 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247		G3V2L1	256 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247		H7C0S8	307 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PRRG1	O14668	218 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	INSIG1	O15503	277 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PRODH	O43272	600 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PMPCB	O75439	489 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	NEBL	O76041	1014 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CD160	O95971	181 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FGB	P02675	491 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	C2	P06681	752 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RHOC	P08134	193 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPINF2	P08697	491 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TPH1	P17752	444 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TYK2	P29597	1187 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CDC25C	P30307	473 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	BMPR1A	P36894	532 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CD151	P48509	253 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SUOX	P51687	545 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	NCALD	P61601	193 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ARF5	P84085	180 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PDE1B	Q01064	536 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	POU4F1	Q01851	419 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PPARD	Q03181	441 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	BST1	Q10588	318 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF235	Q14590	738 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	POU6F1	Q14863	301 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PCLAF	Q15004	111 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CYTH1	Q15438	398 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CNGA3	Q16281	694 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TAF12	Q16514	161 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM240	Q5SV17	173 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CES4A	Q5XG92	561 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	NEPRO	Q6NW34	567 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	GAREM2	Q75VX8	874 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ASRGL1	Q7L266	308 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DENND1C	Q8IV53	801 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		5.55	□□□□□ -1.52

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