RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GALNT5Q7Z7M9 940 aa16.5■□□□□ 0.23
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCB10Q9NRK6 738 aa16.48■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH3GLB1Q9Y371 365 aa16.48■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC189A1A4V9 331 aa16.48■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CES1P23141 567 aa16.48■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa16.48■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPAT3Q53EU6 434 aa16.48■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBASH3BQ8TF42 649 aa16.48■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITCHQ96J02 903 aa16.48■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGEF3Q9NR81 526 aa16.48■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.48■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MCM8Q9UJA3 840 aa16.48■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TELO2Q9Y4R8 837 aa16.48■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARL5AQ9Y689 179 aa16.48■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INSIG1O15503 277 aa16.48■□□□□ 0.23
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