RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 DLGAP1O14490 977 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 AURKAO14965 403 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DCXO43602 365 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PRKAB2O43741 272 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PLIN3O60664 434 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ADAM11O75078 769 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ULK1O75385 1050 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 OR7A10O76100 309 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DDHD2O94830 711 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 MT-CO1P00395 513 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 C1QAP02745 245 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CYP11A1P05108 521 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 THBS1P07996 1170 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 UNGP13051 313 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TYRP1P17643 537 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ACVR2AP27037 513 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SSTR1P30872 391 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SERPINB5P36952 375 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 NR4A2P43354 598 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 NSFP46459 744 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CLCNKBP51801 687 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PLA2G16P53816 162 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CDH15P55291 814 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SSTP61278 116 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 MS4A2Q01362 244 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ZNF33BQ06732 778 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 BFSP2Q13515 415 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 RIN1Q13671 783 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 GNA13Q14344 377 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CTF1Q16619 201 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 NRF1Q16656 503 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PGS1Q32NB8 556 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TFDP3Q5H9I0 405 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 MDH1BQ5I0G3 518 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 XAF1Q6GPH4 301 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 BBS12Q6ZW61 710 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 KCNK18Q7Z418 384 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 USP37Q86T82 979 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 NOXA1Q86UR1 476 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 RHPN2Q8IUC4 686 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ZFPM1Q8IX07 1006 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 THNSL1Q8IYQ7 743 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CLIP4Q8N3C7 705 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 NIPA2Q8N8Q9 360 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 FNDC5Q8NAU1 212 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 HIPK4Q8NE63 616 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 MCUQ8NE86 351 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TTLQ8NG68 377 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 OR13J1Q8NGT2 312 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 OR2T34Q8NGX1 318 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 OR2T3Q8NH03 318 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SDR42E1Q8WUS8 393 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SH3KBP1Q96B97 665 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 OMA1Q96E52 524 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CENPOQ9BU64 300 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 APOL6Q9BWW8 343 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DEFB129Q9H1M3 183 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PPA2Q9H2U2 334 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DSN1Q9H410 356 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 IGFLR1Q9H665 355 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ZBTB26Q9HCK0 441 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 EMC3Q9P0I2 261 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 KLQ9UEF7 1012 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CD300AQ9UGN4 299 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SRRDQ9UH36 339 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TMCC3Q9ULS5 477 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms