RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	GLB1	P16278	677 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	GTF2H3	Q13889	308 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	SPARCL1	Q14515	664 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	INSC	Q1MX18	579 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ISX	Q2M1V0	245 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	MAP9	Q49MG5	647 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	PYCR3	Q53H96	274 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	GPR156	Q8NFN8	814 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	WDR48	Q8TAF3	677 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	GLYATL1	Q969I3	302 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TTC25	Q96NG3	672 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TRABD	Q9H4I3	376 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	GRID2	O43424	1007 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	BRINP1	O60477	761 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	SPAM1	P38567	509 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	DCDC1	P59894	354 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	SNX1	Q13596	522 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	VPS18	Q9P253	973 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	SATB2	Q9UPW6	733 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	C2orf81	A6NN90	581 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ZW10	O43264	779 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TCEA3	O75764	348 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	IFNB1	P01574	187 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	AKT1	P31749	480 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ACTN2	P35609	894 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	HMGCL	P35914	325 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	LMAN1	P49257	510 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	CCZ1B	P86790	482 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TMPRSS15	P98073	1019 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	LRP8	Q14114	963 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	PTPRCAP	Q14761	206 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ARL14	Q8N4G2	192 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	CARD9	Q9H257	536 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	RMI1	Q9H9A7	625 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ARL5A	Q9Y689	179 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ITPR1	Q14643	2758 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880		D6RAR5	112 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	GPR39	O43194	453 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	UGT1A9	O60656	530 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJC6	O75061	913 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	CDK14	O94921	469 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	UGT1A6	P19224	532 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	UGT1A1	P22309	533 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	UGT1A4	P22310	534 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	UGT1A3	P35503	534 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	UGT1A5	P35504	534 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	MAPK9	P45984	424 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	INHBC	P55103	352 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	GDF10	P55107	478 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	OR1D5	P58170	312 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	SEPT6	Q14141	434 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	RTP5	Q14D33	572 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	CHRNA6	Q15825	494 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	PHF19	Q5T6S3	580 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	USP53	Q70EK8	1073 aa		14.64	□□□□□ -0.07

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