RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 CLDN7O95471 211 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 S1PR4O95977 384 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CYBBP04839 570 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 IMPDH2P12268 514 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 DEFB103AP81534 67 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 SULT2A1Q06520 285 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 GRB7Q14451 532 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 OR4D1Q15615 310 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 AP5B1Q2VPB7 878 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 HEATR4Q86WZ0 1026 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIML2Q8N7C3 387 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PPM1MQ96MI6 270 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 TSGA13Q96PP4 275 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM248Q9NWD8 314 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A0J9YYE9 177 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PRAMEF1O95521 474 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 HLA-DPA1P20036 260 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CDC16Q13042 620 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 SPPL2CQ8IUH8 684 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 STAG3L4Q8TBR4 150 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 SYTL2Q9HCH5 934 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CAPN14A8MX76 684 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PER2O15055 1255 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CXCL14O95715 111 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 NEK2P51955 445 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 SFT2D3Q587I9 215 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 KDELC1Q6UW63 502 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 APCDD1Q8J025 514 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 BRSK1Q8TDC3 778 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CASD1Q96PB1 797 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 MARCH5Q9NX47 278 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 HOXA2O43364 376 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 STC2O76061 302 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 GSRP00390 522 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 LPGAT1Q92604 370 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 BOCQ9BWV1 1114 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 AKTIPQ9H8T0 292 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCB8Q9NUT2 735 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF212Q9UDV6 495 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF840PA6NDX5 716 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CLDN11O75508 207 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 GSNP06396 782 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC22A9Q8IVM8 553 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 MYO1HQ8N1T3 1032 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 OSBPL10Q9BXB5 764 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 VTI1BQ9UEU0 232 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PRAMEF11O60813 436 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PKMP14618 531 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CKMT2P17540 419 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 C17orf80Q9BSJ5 609 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ATG10Q9H0Y0 220 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 NDUFAF1Q9Y375 327 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2AG2A6NM03 316 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM24O15164 1050 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 INPPL1O15357 1258 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 MAGEC1O60732 1142 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ECI2O75521 394 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 AOC1P19801 751 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 RPL34P49207 117 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CLCQ05315 142 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 TMTC4Q5T4D3 741 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ADGRF1Q5T601 910 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 RETSATQ6NUM9 610 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CEP295NLQ96MC4 621 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GVM2 712 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 TCAF2A6NFQ2 919 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 SDHDO14521 159 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 FKBP6O75344 327 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 RFPL2O75678 378 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC159P0C7I6 412 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 SYN1P17600 705 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 VEGFBP49765 207 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 HMGCS1Q01581 520 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 IHHQ14623 411 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 TMC5Q6UXY8 1006 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 HERC6Q8IVU3 1022 aa13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms