RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 LYSMD1Q96S90 227 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 OGFRQ9NZT2 677 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 KCND3Q9UK17 655 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 MYO6Q9UM54 1294 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 CHKBQ9Y259 395 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 GRID2O43424 1007 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 NUAK1O60285 661 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 VPS4BO75351 444 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 KATNA1O75449 491 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 RFPL1O75677 317 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 RARAP10276 462 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 TCF4P15884 667 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 CES1P23141 567 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 SERPINB6P35237 376 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 CLCNKAP51800 687 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 PMS2P54278 862 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 SH3BP2P78314 561 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 HSPH1Q92598 858 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 CARD9Q9H257 536 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM83DQ9H4H8 585 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 PCDH18Q9HCL0 1135 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 VPS4AQ9UN37 437 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 SCINQ9Y6U3 715 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 RGSL1A5PLK6 1076 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 CREG1O75629 220 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 KIAA0754O94854 1291 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 NDUFA10O95299 355 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 PDGFAP04085 211 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 FGF5P12034 268 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 TYRP1P17643 537 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 UQCRFS1P47985 274 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 SPINT3P49223 89 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 SEPHS1P49903 392 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 RPL26P61254 145 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 DSC2Q02487 901 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 FHL5Q5TD97 284 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM135Q86UB9 458 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 RNF31Q96EP0 1072 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 OR6C1Q96RD1 312 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 PADI1Q9ULC6 663 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 PIPSLA2A3N6 862 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 CDC14CA4D256 554 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 TTLL8A6PVC2 850 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 UBXN7O94888 489 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 AGFG2O95081 481 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 GNLYP22749 145 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 IL4RP24394 825 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC19A1P41440 591 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 TEKT4Q8WW24 435 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 MAML1Q92585 1016 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF653Q96CK0 615 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 TGM7Q96PF1 710 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 KLC4Q9NSK0 619 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 PKD2L2Q9NZM6 624 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 AMACRQ9UHK6 382 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP11-201ENST00000436287 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTBP11-201ENST00000436287 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP11-201ENST00000436287 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
ACTBP11-201ENST00000436287 MATN3O15232 486 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP11-201ENST00000436287 SPAG6O75602 509 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms