RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 TNFRSF8P28908 595 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 LMAN1P49257 510 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 MMP14P50281 582 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 GPR143P51810 404 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 PPP5CP53041 499 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 ECT2LQ008S8 904 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRC-207ENST00000418674 KCNC3Q14003 757 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRC-207ENST00000418674 HNF4GQ14541 408 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 EFNB3Q15768 340 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
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PTPRC-207ENST00000418674 POGLUT1Q8NBL1 392 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRC-207ENST00000418674 DUSP19Q8WTR2 217 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRC-207ENST00000418674 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP2.9□□□□□ -1.95
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PTPRC-207ENST00000418674 CEP295NLQ96MC4 621 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
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PTPRC-207ENST00000418674 SH3GL2Q99962 352 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRC-207ENST00000418674 OR10A4Q9H209 315 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRC-207ENST00000418674 PIGMQ9H3S5 423 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRC-207ENST00000418674 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 A0A1W2PPE2 198 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 A0A1W2PR64 198 aa2.89□□□□□ -1.95
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PTPRC-207ENST00000418674 OR6C75A6NL08 312 aa2.89□□□□□ -1.95
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PTPRC-207ENST00000418674 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 TAOK1Q7L7X3 1001 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 ZSCAN30Q86W11 494 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 SNX32Q86XE0 403 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRC-207ENST00000418674 FOXRED2Q8IWF2 684 aa2.89□□□□□ -1.95
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