RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-204ENST00000411651 TM6SF2Q9BZW4 377 aa20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-204ENST00000411651 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-204ENST00000411651 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-204ENST00000411651 SARDHQ9UL12 918 aa20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-204ENST00000411651 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-204ENST00000411651 E5RI56 91 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 OR1I1O60431 355 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 NIPSNAP2O75323 286 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 ITGALP20701 1170 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 ART3Q13508 389 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 CCNIQ14094 377 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 HOMEZQ8IX15 550 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 RBFAQ8N0V3 343 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 MID1IP1Q9NPA3 183 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 PFDN4Q9NQP4 134 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 NUDT4Q9NZJ9 180 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.02■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 BTN3A1O00481 513 aa20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 HOXA9P31269 272 aa20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 TAS2R42Q7RTR8 314 aa20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 HPS6Q86YV9 775 aa20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 LEMD2Q8NC56 503 aa20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 EXT2Q93063 718 aa20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 WDR41Q9HAD4 459 aa20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 CDC7O00311 574 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 MAP3K7O43318 606 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 PDE5AO76074 875 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 PRAMEF1O95521 474 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 CHRM3P20309 590 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 CD70P32970 193 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 CA8P35219 290 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 SESN3P58005 492 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 NFATC2Q13469 925 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 PITRM1Q5JRX3 1037 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 CLEC6AQ6EIG7 209 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 KBTBD6Q86V97 674 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 TWIST2Q8WVJ9 160 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 LINGO1Q96FE5 620 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 SLC30A3Q99726 388 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 CORO1BQ9BR76 489 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 FIS1Q9Y3D6 152 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 WASF2Q9Y6W5 498 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 AGAP14A8MT82 685 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 BBIP1A8MTZ0 92 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 PRAMEF12O95522 483 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 RPSAP08865 295 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 ALPIP09923 528 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 SRCP12931 536 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 TCF3P15923 654 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 CDH13P55290 713 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 STX1BP61266 288 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 GRIK2Q13002 908 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 DMC1Q14565 340 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 OGFOD2Q6N063 350 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 GPSM1Q86YR5 675 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 SPNS2Q8IVW8 549 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 PLPP6Q8IY26 295 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 TCF25Q9BQ70 676 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 CLPBQ9H078 707 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 KLHL42Q9P2K6 505 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 PCTPQ9UKL6 214 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 IKZF3Q9UKT9 509 aa20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa19.99■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 GRM6O15303 877 aa19.99■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 ESRRBO95718 433 aa19.99■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 CTPS1P17812 591 aa19.99■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 TPGS1Q6ZTW0 290 aa19.99■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 DHDDSQ86SQ9 333 aa19.99■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 SERPINA9Q86WD7 417 aa19.99■□□□□ 0.79
SUMO3-204ENST00000411651 CMTM8Q8IZV2 173 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms