RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ATG4B-206ENST00000405546 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.022e-8■■■■□ 23.4
ATG4B-206ENST00000405546 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-206ENST00000405546 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
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