RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 F2RL3Q96RI0 385 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMC6Q96SB8 1091 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 AGXT2Q9BYV1 514 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF696Q9H7X3 374 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 LTB4R2Q9NPC1 389 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDP2Q9P2J9 529 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 GJD2Q9UKL4 321 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PPH5 198 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1W2PRG0 241 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CTAGE9A4FU28 777 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM90A26D6RGX4 464 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPHP1O15259 732 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 EDIL3O43854 480 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC25A12O75746 678 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCNK5O95279 499 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHV4-39P01824 125 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CTAGE8P0CG41 777 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAX1P15863 534 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF23P17027 643 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 NR1D1P20393 614 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAF1P21675 1872 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 NR2F2P24468 414 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ICAM3P32942 547 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBA7P41226 1012 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRCPP42785 496 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 F2RL1P55085 397 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERVK11-1P61568 191 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 OLR1P78380 273 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL24P83731 157 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDONQ4KMG0 1287 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 SFMBT2Q5VUG0 894 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CTAGE4Q8IX94 777 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDSUB1Q8N9V3 476 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLHDC9Q8NEP7 349 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PHF21AQ96BD5 680 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM149B1Q96BN6 582 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCRN2Q96FV2 425 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 WBP1Q96G27 269 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEMA3CQ99985 751 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 BARHL1Q9BZE3 327 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 SIL1Q9H173 461 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBN1Q9NPG3 1134 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ABI3Q9P2A4 366 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 STK39Q9UEW8 545 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRAG1Q86YV5 1406 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR5K3A6NET4 321 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TGFB1I1O43294 461 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCDH7O60245 1069 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAGE4O60829 102 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 CTSVO60911 334 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 MLYCDO95822 493 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 AGR2O95994 175 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TUBBP07437 444 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 UGT1A1P22309 533 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 AHRP35869 848 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 HSD17B4P51659 736 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 MLLT10P55197 1068 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TUBB4BP68371 445 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACVR2BQ13705 512 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTCAP3Q53RY4 240 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAF1Q8N7H5 531 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 STPG4Q8N801 248 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 RDM1Q8NG50 284 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR1J2Q8NGS2 313 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM76AQ8TAV0 307 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 HM13Q8TCT9 377 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCNG4Q8TDN1 519 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TM9SF4Q92544 642 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF524Q96C55 264 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGEF26Q96DR7 871 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 TBATAQ96M53 351 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAP7D2Q96T17 732 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 STRA6Q9BX79 667 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 JMJD4Q9H9V9 463 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCPEP1Q9HB40 452 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 COPG2Q9UBF2 871 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 JRKLQ9Y4A0 524 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMIM1B2RUZ4 78 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 H3BQ06 376 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP2A1O14983 1001 aa2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms