RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 AP2M1Q96CW1 435 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 INSIG1O15503 277 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PEX10O60683 326 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SCAIQ8N9R8 606 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SLC47A1Q96FL8 570 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 GINS4Q9BRT9 223 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.17■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 H3BNH8 94 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 RPIAP49247 311 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 FSTL1Q12841 308 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 GLYATQ6IB77 296 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 LINGO4Q6UY18 593 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 DEF8Q6ZN54 512 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PARGQ86W56 976 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 FEM1CQ96JP0 617 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CMTM6Q9NX76 183 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 RPTORQ8N122 1335 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SLC25A12O75746 678 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CLDN9O95484 217 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 IDSP22304 550 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PAX7P23759 505 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CPA6Q8N4T0 437 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CLHC1Q8NHS4 586 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SLC7A4O43246 635 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SIN3BO75182 1162 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ZSWIM7Q19AV6 140 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 FSTL4Q6MZW2 842 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TIMM22Q9Y584 194 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SLC20A2Q08357 652 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 LGALS3BPQ08380 585 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 NAE1Q13564 534 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 MUC13Q9H3R2 512 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 AK5Q9Y6K8 562 aa20.16■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CHST9Q7L1S5 443 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SPOCK2Q92563 424 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 DBTP11182 482 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PTGIRP43119 386 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 CLCQ05315 142 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 DPYSQ14117 519 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD21Q4G0X4 260 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 IKBIPQ70UQ0 350 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 SIX2Q9NPC8 291 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 G3V2T6 193 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 BNIP1Q12981 228 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 IL23RQ5VWK5 629 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 MGRN1O60291 552 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ESR1P03372 595 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 LMO2P25791 158 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 LSM3P62310 102 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 FAM47BQ8NA70 645 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTS15Q8TE58 950 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 HMCESQ96FZ2 354 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 DTLQ9NZJ0 730 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 STON1Q9Y6Q2 735 aa20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
CCSAP-203ENST00000366687 RGS21Q2M5E4 152 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 KRT74Q7RTS7 529 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 HPS6Q86YV9 775 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms